Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 YDR210WYDR210W 228 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 YDL152WYDL152W 366 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 YNR077CYNR077C 255 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 SOV1YMR066W 2697 nt-0.46□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 YPL197CYPL197C 414 nt-0.47□□□□□ -2.48
TY1B-NL1Q12112 BSC3YLR465C 309 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 snR24snR24 89 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 ERV15YBR210W 429 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 NPC2YDL046W 522 nt-0.48□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 TDA2YER071C 381 nt-0.48□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 ORC3YLL004W 1851 nt-0.48□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 COX5BYIL111W 456 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 OLI1Q0130 231 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 RUF20RUF20 443 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 YNL171CYNL171C 369 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 ATP20YPR020W 348 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 RSM18YER050C 417 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 YPL044CYPL044C 549 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 YPR099CYPR099C 357 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 BI4Q0120 1917 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 MAM33YIL070C 801 nt-0.51□□□□□ -2.49
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TY1B-NL1Q12112 RPS10BYMR230W 318 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 YPL185WYPL185W 396 nt-0.51□□□□□ -2.49
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TY1B-NL1Q12112 YOL118CYOL118C 309 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 PET20YPL159C 762 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 YBR206WYBR206W 324 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 MMS21YEL019C 804 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 EMC4YGL231C 573 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 PFS1YHR185C 714 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-NL1Q12112 GSP1YLR293C 660 nt-0.52□□□□□ -2.49
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TY1B-NL1Q12112 YEL073CYEL073C 324 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 snR128snR128 126 nt-0.55□□□□□ -2.5
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TY1B-NL1Q12112 VPS63YLR261C 327 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 CDC33YOL139C 642 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 ASE1YOR058C 2658 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 ECM9YKR004C 1134 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 HTB1YDR224C 396 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 NIP1YMR309C 2439 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-NL1Q12112 RUB1YDR139C 234 nt-0.58□□□□□ -2.5
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TY1B-NL1Q12112 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.58□□□□□ -2.5
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TY1B-NL1Q12112 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-NL1Q12112 OST4YDL232W 111 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-NL1Q12112 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-NL1Q12112 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.66□□□□□ -2.51
TY1B-NL1Q12112 PAN3YKL025C 2040 nt-0.66□□□□□ -2.52
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TY1B-NL1Q12112 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.67□□□□□ -2.52
TY1B-NL1Q12112 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-NL1Q12112 NFU1YKL040C 771 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-NL1Q12112 MRPL31YKL138C 396 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-NL1Q12112 YNL146WYNL146W 303 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-NL1Q12112 MCM10YIL150C 1716 nt-0.68□□□□□ -2.52
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TY1B-NL1Q12112 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-NL1Q12112 YFR057WYFR057W 456 nt-0.72□□□□□ -2.52
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TY1B-NL1Q12112 snR57snR57 88 nt-0.73□□□□□ -2.53
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