Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 YDR269CYDR269C 324 nt0.73□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 RPF1YHR088W 888 nt0.73□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 RRT1YBL048W 312 nt0.73□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 PBI2YNL015W 228 nt0.73□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 PDE2YOR360C 1581 nt0.72□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 EAF6YJR082C 342 nt0.72□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.72□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.72□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 FIG4YNL325C 2640 nt0.72□□□□□ -2.29
SSQ1Q05931 YDL206WYDL206W 2289 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YDL196WYDL196W 330 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 NHP2YDL208W 471 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 WIP1YDR374W-A 270 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YDR521WYDR521W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 SEC1YDR164C 2175 nt0.71□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.7□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 CMC4YMR194C-B 222 nt0.7□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YOR029WYOR029W 336 nt0.7□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YPL182CYPL182C 384 nt0.7□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YPR153WYPR153W 423 nt0.7□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 PAC1YOR269W 1485 nt0.69□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 NPC2YDL046W 522 nt0.69□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YGR042WYGR042W 816 nt0.69□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 MMS4YBR098W 2076 nt0.68□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 SLI15YBR156C 2097 nt0.68□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 SWF1YDR126W 1011 nt0.68□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 STF2YGR008C 255 nt0.68□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.68□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YJR003CYJR003C 1560 nt0.68□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YML108WYML108W 318 nt0.68□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 RKR1YMR247C 4689 nt0.67□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 AIM29YKR074W 468 nt0.67□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 HUG1YML058W-A 207 nt0.67□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 CDC33YOL139C 642 nt0.67□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 COG4YPR105C 2586 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 PAN2YGL094C 3348 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.66□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 ZIP2YGL249W 2115 nt0.65□□□□□ -2.3
SSQ1Q05931 TIM13YGR181W 318 nt0.65□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YHR125WYHR125W 306 nt0.65□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YJL135WYJL135W 318 nt0.65□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 EFR3YMR212C 2349 nt0.65□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YDL158CYDL158C 309 nt0.64□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YHL042WYHL042W 453 nt0.64□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YKL202WYKL202W 582 nt0.64□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YBL071CYBL071C 309 nt0.64□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 ZEO1YOL109W 342 nt0.64□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 LOA1YPR139C 903 nt0.64□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YDL011CYDL011C 324 nt0.63□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 INA22YIR024C 651 nt0.63□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YOL160WYOL160W 342 nt0.63□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 WAR1YML076C 2835 nt0.62□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 ALG13YGL047W 609 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YHR130CYHR130C 336 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 RPS27AYKL156W 249 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 UBC7YMR022W 498 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 RPS30BYOR182C 192 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 OST1YJL002C 1431 nt0.61□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 snR72snR72 98 nt0.6□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 BI2Q0110 1272 nt0.6□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YNL122CYNL122C 348 nt0.6□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YPL261CYPL261C 309 nt0.6□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 YML002WYML002W 2214 nt0.6□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 FYV7YLR068W 456 nt0.59□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 RPL38YLR325C 237 nt0.59□□□□□ -2.31
SSQ1Q05931 RAD34YDR314C 2079 nt0.58□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 BFR2YDR299W 1605 nt0.58□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 ISD11YER048W-A 285 nt0.58□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 YGR290WYGR290W 444 nt0.58□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.58□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 LTE1YAL024C 4308 nt0.57□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 GPG1YGL121C 381 nt0.57□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 YLR287CYLR287C 1068 nt0.57□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 ECM12YHR021W-A 456 nt0.56□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.56□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 IES4YOR189W 351 nt0.56□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 RPB10YOR210W 213 nt0.56□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 snR51snR51 107 nt0.56□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 snR54snR54 86 nt0.56□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 DBP6YNR038W 1890 nt0.56□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 DIE2YGR227W 1578 nt0.55□□□□□ -2.32
SSQ1Q05931 CBS1YDL069C 690 nt0.55□□□□□ -2.32
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