Protein–RNA interactions for Protein: Q05899

YLR297W, Uncharacterized vacuolar protein YLR297W, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR297WQ05899 EFR3YMR212C 2349 nt1.04□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 TIM13YGR181W 318 nt1.04□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 SET3YKR029C 2256 nt1.04□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 VAM6YDL077C 3150 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 YDL011CYDL011C 324 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 CYC7YEL039C 342 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 YKL202WYKL202W 582 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.03□□□□□ -2.24
YLR297WQ05899 SCC2YDR180W 4482 nt1.03□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 NUP157YER105C 4176 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 WIP1YDR374W-A 270 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 ECL1YGR146C 636 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 RRT1YBL048W 312 nt1.02□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 LCD1YDR499W 2244 nt1.01□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YPR117WYPR117W 7470 nt1.01□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 MMS4YBR098W 2076 nt1□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YOR199WYOR199W 330 nt1□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 LOA1YPR139C 903 nt1□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 KAP120YPL125W 3099 nt1□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 DIE2YGR227W 1578 nt1□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 PDE2YOR360C 1581 nt1□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 STO1YMR125W 2586 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 NPC2YDL046W 522 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YLR287CYLR287C 1068 nt0.99□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 ZIP2YGL249W 2115 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 SLI15YBR156C 2097 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 SLD3YGL113W 2007 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 DOP1YDR141C 5097 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 FIG4YNL325C 2640 nt0.98□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 STF2YGR008C 255 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YLR101CYLR101C 396 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 PAU24YBR301W 363 nt0.97□□□□□ -2.25
YLR297WQ05899 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.96□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 IRC23YOR044W 474 nt0.96□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YJR003CYJR003C 1560 nt0.96□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.95□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 PAN2YGL094C 3348 nt0.95□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 AIM9YER080W 1884 nt0.95□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YJL135WYJL135W 318 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 UBC7YMR022W 498 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 TOM22YNL131W 459 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 ATP19YOL077W-A 207 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YOL160WYOL160W 342 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YPL261CYPL261C 309 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 COG4YPR105C 2586 nt0.94□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YDL206WYDL206W 2289 nt0.93□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 CBS1YDL069C 690 nt0.93□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.93□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 MRPL50YNR022C 420 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 YPL229WYPL229W 621 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 snR41snR41 95 nt0.92□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 IFH1YLR223C 3258 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 PAM16YJL104W 450 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 HUG1YML058W-A 207 nt0.91□□□□□ -2.26
YLR297WQ05899 RPB10YOR210W 213 nt0.9□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 RIM20YOR275C 1986 nt0.9□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YDL073WYDL073W 2955 nt0.9□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 PRP16YKR086W 3216 nt0.88□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 snR51snR51 107 nt0.88□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 RAD34YDR314C 2079 nt0.88□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 WAR1YML076C 2835 nt0.87□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 GPG1YGL121C 381 nt0.87□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YHL042WYHL042W 453 nt0.87□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YOR029WYOR029W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 SMC1YFL008W 3678 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YDL196WYDL196W 330 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YAP6YDR259C 1152 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 SDH7YDR511W 402 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YGR042WYGR042W 816 nt0.86□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 snR72snR72 98 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.85□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YIR044CYIR044C 186 nt0.84□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YKL083WYKL083W 615 nt0.84□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YAR047CYAR047C 321 nt0.84□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 INP2YMR163C 2118 nt0.84□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 YNL058CYNL058C 951 nt0.84□□□□□ -2.27
YLR297WQ05899 PKH2YOL100W 3246 nt0.83□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 YHL041WYHL041W 450 nt0.83□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 RPS24BYIL069C 408 nt0.83□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 RPL26AYLR344W 384 nt0.83□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 NHP2YDL208W 471 nt0.82□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 ISD11YER048W-A 285 nt0.82□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 PAC1YOR269W 1485 nt0.81□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 YDR521WYDR521W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 ISF1YMR081C 1017 nt0.81□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 NIP100YPL174C 2607 nt0.8□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 ATG31YDR022C 591 nt0.8□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 SWF1YDR126W 1011 nt0.8□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 RPS20YHL015W 366 nt0.8□□□□□ -2.28
YLR297WQ05899 PCF11YDR228C 1881 nt0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.4 ms