Protein–RNA interactions for Protein: P47024

TY4B-J, Transposon Ty4-J Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-JP47024 MLP1YKR095W 5628 nt0.15□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 snR84snR84 550 nt0.14□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 GMC2YLR445W 567 nt0.14□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 RPL32YBL092W 393 nt0.14□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YOR364WYOR364W 369 nt0.14□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 BI4Q0120 1917 nt0.14□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 PAN3YKL025C 2040 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 MRPL50YNR022C 420 nt0.13□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YOR248WYOR248W 303 nt0.12□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.11□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 ULI1YFR026C 510 nt0.11□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YPR170CYPR170C 336 nt0.11□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 PMP1YCR024C-A 123 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 RPL26BYGR034W 384 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YKL111CYKL111C 336 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YLR217WYLR217W 324 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YBL062WYBL062W 381 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 TIM10YHR005C-A 282 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 LOA1YPR139C 903 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YLL032CYLL032C 2478 nt0.1□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 PET111YMR257C 2403 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 VAM3YOR106W 852 nt0.09□□□□□ -2.39
TY4B-JP47024 PRP21YJL203W 843 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 NOP9YJL010C 2001 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 VIK1YPL253C 1944 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YLR271WYLR271W 825 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YPR096CYPR096C 303 nt0.08□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 AFR1YDR085C 1863 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 GLG1YKR058W 1851 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YDR220CYDR220C 294 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YGR115CYGR115C 780 nt0.07□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 snR5snR5 204 nt0.06□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 BIG1YHR101C 1008 nt0.06□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt0.06□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YBR064WYBR064W 429 nt0.06□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 QCR7YDR529C 384 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 SBH1YER087C-B 249 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YHL042WYHL042W 453 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YLR252WYLR252W 306 nt0.05□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 VMA21YGR105W 234 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 RCN2YOR220W 798 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YPR153WYPR153W 423 nt0.04□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YBR071WYBR071W 636 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 RFX1YLR176C 2436 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YJR079WYJR079W 330 nt0.03□□□□□ -2.4
TY4B-JP47024 YCL002CYCL002C 792 nt0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 CWC23YGL128C 852 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 RSM27YGR215W 333 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YNL050CYNL050C 813 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YOL160WYOL160W 342 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YPL044CYPL044C 549 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 CSM4YPL200W 471 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 HAL9YOL089C 3093 nt0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 MYO1YHR023W 5787 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 NPC2YDL046W 522 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 BUD26YDR241W 288 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YER138W-AYER138W-A 105 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 ZIP2YGL249W 2115 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YJL135WYJL135W 318 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 LEE1YPL054W 906 nt0□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 IRC16YPR038W 360 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 INP2YMR163C 2118 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YGL015CYGL015C 393 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 RPL26AYLR344W 384 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 OLI1Q0130 231 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YJL007CYJL007C 315 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 MRPL31YKL138C 396 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 YNL150WYNL150W 408 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 CDC33YOL139C 642 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 ILM1YJR118C 612 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 BSC3YLR465C 309 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 RPB10YOR210W 213 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 FYV10YIL097W 1551 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY4B-JP47024 AFB1YLR040C 675 nt-0.03□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 RPL35AYDL191W 363 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YFR057WYFR057W 456 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 HUR1YGL168W 333 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 CUL3YGR003W 2235 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YDL187CYDL187C 330 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YGR228WYGR228W 345 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 SDS22YKL193C 1017 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YPT6YLR262C 648 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 YDR269CYDR269C 324 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 CMC1YKL137W 336 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 snR190snR190 190 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 PRP42YDR235W 1635 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY4B-JP47024 NIP100YPL174C 2607 nt-0.07□□□□□ -2.42
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