Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 IRC16YPR038W 360 nt0.41□□□□□ -2.34
CCS1P40202 ALY2YJL084C 3141 nt0.41□□□□□ -2.34
CCS1P40202 RFX1YLR176C 2436 nt0.4□□□□□ -2.34
CCS1P40202 NPC2YDL046W 522 nt0.4□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.4□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.4□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YIL059CYIL059C 366 nt0.4□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.4□□□□□ -2.35
CCS1P40202 RPL38YLR325C 237 nt0.4□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YIL029CYIL029C 429 nt0.39□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.39□□□□□ -2.35
CCS1P40202 PRP21YJL203W 843 nt0.39□□□□□ -2.35
CCS1P40202 HUG1YML058W-A 207 nt0.39□□□□□ -2.35
CCS1P40202 ULP2YIL031W 3105 nt0.38□□□□□ -2.35
CCS1P40202 PAC1YOR269W 1485 nt0.38□□□□□ -2.35
CCS1P40202 BFR2YDR299W 1605 nt0.38□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YJR003CYJR003C 1560 nt0.37□□□□□ -2.35
CCS1P40202 ISD11YER048W-A 285 nt0.37□□□□□ -2.35
CCS1P40202 VMA21YGR105W 234 nt0.37□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YOR218CYOR218C 420 nt0.37□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YDR269CYDR269C 324 nt0.36□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.36□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.36□□□□□ -2.35
CCS1P40202 RCN2YOR220W 798 nt0.36□□□□□ -2.35
CCS1P40202 FMP27YLR454W 7887 nt0.36□□□□□ -2.35
CCS1P40202 MYO1YHR023W 5787 nt0.35□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.35□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YKL044WYKL044W 321 nt0.35□□□□□ -2.35
CCS1P40202 ZIP2YGL249W 2115 nt0.35□□□□□ -2.35
CCS1P40202 YER135CYER135C 393 nt0.34□□□□□ -2.36
CCS1P40202 HUR1YGL168W 333 nt0.34□□□□□ -2.36
CCS1P40202 APQ13YJL075C 417 nt0.34□□□□□ -2.36
CCS1P40202 PHS1YJL097W 654 nt0.34□□□□□ -2.36
CCS1P40202 RPL9AYGL147C 576 nt0.33□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YGL239CYGL239C 315 nt0.33□□□□□ -2.36
CCS1P40202 GPG1YGL121C 381 nt0.32□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YGR025WYGR025W 303 nt0.32□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.32□□□□□ -2.36
CCS1P40202 LOA1YPR139C 903 nt0.32□□□□□ -2.36
CCS1P40202 EFR3YMR212C 2349 nt0.31□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YOR282WYOR282W 321 nt0.31□□□□□ -2.36
CCS1P40202 CHS6YJL099W 2241 nt0.31□□□□□ -2.36
CCS1P40202 NPR2YEL062W 1848 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 PMP1YCR024C-A 123 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YJL135WYJL135W 318 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 BER1YLR412W 825 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 snR13snR13 124 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 SVS1YPL163C 783 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 Q0255Q0255 1419 nt0.3□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YSP1YHR155W 3687 nt0.29□□□□□ -2.36
CCS1P40202 PKH2YOL100W 3246 nt0.29□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YDR344CYDR344C 444 nt0.29□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YHL042WYHL042W 453 nt0.29□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YJR141WYJR141W 1044 nt0.29□□□□□ -2.36
CCS1P40202 PAN2YGL094C 3348 nt0.29□□□□□ -2.36
CCS1P40202 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.28□□□□□ -2.36
CCS1P40202 NOP9YJL010C 2001 nt0.27□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YDR029WYDR029W 315 nt0.27□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.27□□□□□ -2.37
CCS1P40202 ABF2YMR072W 552 nt0.27□□□□□ -2.37
CCS1P40202 RPB10YOR210W 213 nt0.27□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YDL016CYDL016C 303 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 RPL26BYGR034W 384 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 RPS24BYIL069C 408 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 CDC33YOL139C 642 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 TSC3YBR058C-A 243 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 SNU56YDR240C 1479 nt0.26□□□□□ -2.37
CCS1P40202 RPS27AYKL156W 249 nt0.25□□□□□ -2.37
CCS1P40202 UBX4YMR067C 1251 nt0.25□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.24□□□□□ -2.37
CCS1P40202 AI1Q0050 2505 nt0.23□□□□□ -2.37
CCS1P40202 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.23□□□□□ -2.37
CCS1P40202 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.23□□□□□ -2.37
CCS1P40202 snR72snR72 98 nt0.23□□□□□ -2.37
CCS1P40202 SBH1YER087C-B 249 nt0.23□□□□□ -2.37
CCS1P40202 BIG1YHR101C 1008 nt0.23□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.23□□□□□ -2.37
CCS1P40202 BIR1YJR089W 2865 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 BSC3YLR465C 309 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 UBC7YMR022W 498 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YOL160WYOL160W 342 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YPL182CYPL182C 384 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YCK3YER123W 1575 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 IQG1YPL242C 4488 nt0.22□□□□□ -2.37
CCS1P40202 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.21□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YKL202WYKL202W 582 nt0.21□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YPL044CYPL044C 549 nt0.21□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.21□□□□□ -2.38
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