Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00271P0C7V0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms