Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARID3CA6NKF2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ARID3CA6NKF2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ARID3CA6NKF2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms