Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms