Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms