Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms