Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNE4Q8N205 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNE4Q8N205 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms