Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms