Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms