Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 GIM4YEL003W 336 nt1.81□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YOR146WYOR146W 306 nt1.81□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 MSH5YDL154W 2706 nt1.81□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 ZRG17YNR039C 1818 nt1.8□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.8□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 BSC3YLR465C 309 nt1.8□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 CDC31YOR257W 486 nt1.8□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YDR008CYDR008C 351 nt1.79□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YGL239CYGL239C 315 nt1.79□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.79□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 HHT1YBR010W 411 nt1.79□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YPL182CYPL182C 384 nt1.79□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 KCS1YDR017C 3153 nt1.78□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.78□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.78□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 HIT1YJR055W 495 nt1.78□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YOR029WYOR029W 336 nt1.78□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 SXM1YDR395W 2835 nt1.78□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.77□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 RPL9BYNL067W 576 nt1.77□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 PCF11YDR228C 1881 nt1.77□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 ATG31YDR022C 591 nt1.76□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.76□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 RPS27AYKL156W 249 nt1.76□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 BST1YFL025C 3090 nt1.76□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YDL011CYDL011C 324 nt1.75□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 RPL32YBL092W 393 nt1.75□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 ZIP1YDR285W 2628 nt1.75□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 CAT8YMR280C 4302 nt1.75□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 WIP1YDR374W-A 270 nt1.74□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 TIM13YGR181W 318 nt1.74□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 PHS1YJL097W 654 nt1.74□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 HCH1YNL281W 462 nt1.74□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YOR121CYOR121C 306 nt1.74□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 PIP2YOR363C 2991 nt1.74□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 BRR2YER172C 6492 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 NCA2YPR155C 1851 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 ALK1YGL021W 2283 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YJL022WYJL022W 309 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YKL083WYKL083W 615 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 RPL26AYLR344W 384 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YBR012CYBR012C 420 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YOP1YPR028W 543 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 SPC110YDR356W 2835 nt1.73□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.72□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.72□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 COF1YLL050C 432 nt1.72□□□□□ -2.13
RTP1Q12751 MSH3YCR092C 3057 nt1.71□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YAP6YDR259C 1152 nt1.71□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 EMC5YIL027C 426 nt1.71□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.71□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 MLH3YPL164C 2148 nt1.71□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YLR419WYLR419W 4308 nt1.71□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 ADR1YDR216W 3972 nt1.71□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 SWI6YLR182W 2412 nt1.7□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.7□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 SEC5YDR166C 2916 nt1.7□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YGR130CYGR130C 2451 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 SMC4YLR086W 4257 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 LYS14YDR034C 2373 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 SRP14YDL092W 441 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YLR140WYLR140W 327 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 ISF1YMR081C 1017 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 MVP1YMR004W 1536 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 AIM9YER080W 1884 nt1.69□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 POL5YEL055C 3069 nt1.68□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 PAU2YEL049W 363 nt1.68□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 MEC1YBR136W 7107 nt1.68□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 PXA2YKL188C 2562 nt1.67□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 SSK2YNR031C 4740 nt1.67□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YIL102CYIL102C 306 nt1.67□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 VPS55YJR044C 423 nt1.67□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YOR376WYOR376W 369 nt1.67□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YPL229WYPL229W 621 nt1.67□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 DGR2YKL121W 2559 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 UFD2YDL190C 2886 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 RTR1YER139C 681 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YGR035CYGR035C 351 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 PFD1YJL179W 330 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YPR197CYPR197C 564 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 RAD50YNL250W 3939 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 RKM1YPL208W 1752 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 KAP122YGL016W 3246 nt1.66□□□□□ -2.14
RTP1Q12751 YJR003CYJR003C 1560 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 Q0142Q0142 177 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YJL015CYJL015C 285 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 RPL40BYKR094C 387 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YAR053WYAR053W 297 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 IRC23YOR044W 474 nt1.65□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 HKR1YDR420W 5409 nt1.63□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YBP1YBR216C 2025 nt1.63□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YGL217CYGL217C 342 nt1.63□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YHL041WYHL041W 450 nt1.63□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 TIM18YOR297C 579 nt1.63□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 IRA1YBR140C 9279 nt1.63□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 EFR3YMR212C 2349 nt1.62□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 EST2YLR318W 2655 nt1.62□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YIL059CYIL059C 366 nt1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 150.5 ms