Protein–RNA interactions for Protein: Q06063

DUS4, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+], yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS4Q06063 PDR11YIL013C 4236 nt2.66□□□□□ -1.98
DUS4Q06063 YEL043WYEL043W 2871 nt2.66□□□□□ -1.98
DUS4Q06063 ESL2YKR096W 3588 nt2.66□□□□□ -1.98
DUS4Q06063 SMY1YKL079W 1971 nt2.66□□□□□ -1.98
DUS4Q06063 PHO91YNR013C 2685 nt2.65□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 PMP1YCR024C-A 123 nt2.65□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.65□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.65□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 GEA1YJR031C 4227 nt2.65□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 SRB8YCR081W 4284 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 RGR1YLR071C 3249 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 PXA2YKL188C 2562 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 SUL1YBR294W 2580 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 MCM10YIL150C 1716 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 CLN3YAL040C 1743 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 ELG1YOR144C 2376 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 MSB1YOR188W 3414 nt2.64□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 MPT5YGL178W 2580 nt2.63□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 SWI6YLR182W 2412 nt2.63□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 PRP8YHR165C 7242 nt2.63□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 SRO77YBL106C 3033 nt2.63□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 ATP7YKL016C 525 nt2.63□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YOR345CYOR345C 351 nt2.63□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 PFF1YBR074W 2931 nt2.63□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 NET1YJL076W 3570 nt2.62□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 snR72snR72 98 nt2.62□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YHR210CYHR210C 1026 nt2.62□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 PEP3YLR148W 2757 nt2.62□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 ARP8YOR141C 2646 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 CAF120YNL278W 3183 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 FMP16YDR070C 282 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 RPL42BYHR141C 321 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YIR044CYIR044C 186 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 RPL42AYNL162W 321 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 RPL33BYOR234C 324 nt2.61□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 NOP10YHR072W-A 177 nt2.6□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.6□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 NUM1YDR150W 8247 nt2.59□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 TAE2YPL009C 3117 nt2.59□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 NUP170YBL079W 4509 nt2.59□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.59□□□□□ -1.99
DUS4Q06063 PUT3YKL015W 2940 nt2.58□□□□□ -2
DUS4Q06063 SAP1YER047C 2694 nt2.58□□□□□ -2
DUS4Q06063 PRP6YBR055C 2700 nt2.58□□□□□ -2
DUS4Q06063 NUP120YKL057C 3114 nt2.58□□□□□ -2
DUS4Q06063 HRD3YLR207W 2502 nt2.58□□□□□ -2
DUS4Q06063 SMC6YLR383W 3345 nt2.58□□□□□ -2
DUS4Q06063 RIC1YLR039C 3171 nt2.57□□□□□ -2
DUS4Q06063 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.57□□□□□ -2
DUS4Q06063 MMS1YPR164W 4224 nt2.57□□□□□ -2
DUS4Q06063 SSN2YDR443C 4263 nt2.57□□□□□ -2
DUS4Q06063 YIL080WYIL080W 4722 nt2.57□□□□□ -2
DUS4Q06063 ISW1YBR245C 3390 nt2.57□□□□□ -2
DUS4Q06063 REV3YPL167C 4515 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 TOR1YJR066W 7413 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 SLY1YDR189W 2001 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 TFB5YDR079C-A 219 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 YDR544CYDR544C 429 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 HYP2YEL034W 474 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 YGR050CYGR050C 357 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 CYR1YJL005W 6081 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 KAP123YER110C 3342 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 TFC8YPL007C 1767 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 RPH1YER169W 2391 nt2.56□□□□□ -2
DUS4Q06063 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 INP53YOR109W 3324 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 FLO11YIR019C 4104 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 YMR326CYMR326C 309 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 YNL114CYNL114C 372 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 MNL2YLR057W 2550 nt2.55□□□□□ -2
DUS4Q06063 MSC6YOR354C 2079 nt2.54□□□□□ -2
DUS4Q06063 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.54□□□□□ -2
DUS4Q06063 RFX1YLR176C 2436 nt2.54□□□□□ -2
DUS4Q06063 SWI5YDR146C 2130 nt2.54□□□□□ -2
DUS4Q06063 SIR3YLR442C 2937 nt2.54□□□□□ -2
DUS4Q06063 PIG1YLR273C 1947 nt2.54□□□□□ -2
DUS4Q06063 MRD1YPR112C 2664 nt2.54□□□□□ -2
DUS4Q06063 COY1YKL179C 2040 nt2.53□□□□□ -2
DUS4Q06063 GIS1YDR096W 2685 nt2.53□□□□□ -2
DUS4Q06063 SCH9YHR205W 2475 nt2.53□□□□□ -2
DUS4Q06063 SWR1YDR334W 4545 nt2.52□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 SRP14YDL092W 441 nt2.52□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YDR209CYDR209C 414 nt2.52□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.52□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YBL012CYBL012C 402 nt2.52□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 AFI1YOR129C 2682 nt2.51□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 BRP1YGL007W 378 nt2.51□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 ACM1YPL267W 630 nt2.51□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 VMR1YHL035C 4779 nt2.51□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YKU80YMR106C 1890 nt2.51□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 DUG2YBR281C 2637 nt2.51□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 MET6YER091C 2304 nt2.51□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 SPC98YNL126W 2541 nt2.5□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 VPS16YPL045W 2397 nt2.5□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 SAP190YKR028W 3102 nt2.5□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 CRM1YGR218W 3255 nt2.5□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 GCV2YMR189W 3105 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.2 ms