Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC63Q05C16 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms