Protein–RNA interactions for Protein: Q04031

RRP17, Ribosomal RNA-processing protein 17, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP17Q04031 YDR008CYDR008C 351 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 YGR045CYGR045C 363 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 SPO13YHR014W 876 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 RUF22RUF22 515 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 DCP1YOL149W 696 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 YBR032WYBR032W 303 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 SET3YKR029C 2256 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 AFR1YDR085C 1863 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 APL2YKL135C 2181 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 SLX9YGR081C 633 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 SPO11YHL022C 1197 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 SLM6YBR266C 453 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP17Q04031 UBP3YER151C 2739 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 SPO23YBR250W 1572 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YLR252WYLR252W 306 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 GMC2YLR445W 567 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YNL050CYNL050C 813 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 GRX5YPL059W 453 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YBR071WYBR071W 636 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YDR114CYDR114C 303 nt0.57□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 HIT1YJR055W 495 nt0.57□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.57□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 STO1YMR125W 2586 nt0.57□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 LYS14YDR034C 2373 nt0.57□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 PPN1YDR452W 2025 nt0.57□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 SCW11YGL028C 1629 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YML002WYML002W 2214 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 SLD3YGL113W 2007 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 SDH2YLL041C 801 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 RPL38YLR325C 237 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 FIG4YNL325C 2640 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 AIM44YPL158C 2277 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 MXR1YER042W 555 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 AFB1YLR040C 675 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YOL029CYOL029C 606 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YDL206WYDL206W 2289 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YOR199WYOR199W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 RIM20YOR275C 1986 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YDL196WYDL196W 330 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 YOR248WYOR248W 303 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 ENV11YGR071C 2583 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP17Q04031 PDE2YOR360C 1581 nt0.53□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 PXA2YKL188C 2562 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 PRP21YJL203W 843 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 IRC16YPR038W 360 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 SWI6YLR182W 2412 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 SWF1YDR126W 1011 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 SLY1YDR189W 2001 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YIL029CYIL029C 429 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 UPS1YLR193C 528 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YPR039WYPR039W 336 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 OCA6YDR067C 675 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YLL032CYLL032C 2478 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 LCD1YDR499W 2244 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 ALY2YJL084C 3141 nt0.49□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.49□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 VMA21YGR105W 234 nt0.49□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 RPL32YBL092W 393 nt0.49□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 MRPL31YKL138C 396 nt0.48□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 RRT1YBL048W 312 nt0.48□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 MMS4YBR098W 2076 nt0.48□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 Q0255Q0255 1419 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YKL044WYKL044W 321 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YOR029WYOR029W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 YPR153WYPR153W 423 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 RFX1YLR176C 2436 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP17Q04031 MET32YDR253C 576 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 YGR042WYGR042W 816 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 YIL059CYIL059C 366 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 IES4YOR189W 351 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 WAR1YML076C 2835 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 YSP1YHR155W 3687 nt0.45□□□□□ -2.34
RRP17Q04031 YER135CYER135C 393 nt0.45□□□□□ -2.34
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