Protein–RNA interactions for Protein: Q03579

LIP1, Ceramide synthase subunit LIP1, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LIP1Q03579 SLY1YDR189W 2001 nt0.43□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 MMS4YBR098W 2076 nt0.42□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 GPM2YDL021W 936 nt0.42□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 ALG13YGL047W 609 nt0.42□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.42□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 CSM4YPL200W 471 nt0.42□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YML002WYML002W 2214 nt0.42□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 LTE1YAL024C 4308 nt0.42□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 LCD1YDR499W 2244 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 NHP2YDL208W 471 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YDR521WYDR521W 336 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 ECM12YHR021W-A 456 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 UPS1YLR193C 528 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 CMC4YMR194C-B 222 nt0.41□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 DBP6YNR038W 1890 nt0.4□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.4□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 VAM3YOR106W 852 nt0.4□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YPR153WYPR153W 423 nt0.4□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YCL002CYCL002C 792 nt0.4□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 APL2YKL135C 2181 nt0.4□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YDL032WYDL032W 312 nt0.39□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YJR079WYJR079W 330 nt0.39□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 RRT1YBL048W 312 nt0.39□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 WAR1YML076C 2835 nt0.39□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 PAC1YOR269W 1485 nt0.38□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YLR366WYLR366W 306 nt0.38□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.38□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YLL032CYLL032C 2478 nt0.38□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 snR9snR9 187 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 MET32YDR253C 576 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 ISD11YER048W-A 285 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 MND1YGL183C 660 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YGR042WYGR042W 816 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YIL059CYIL059C 366 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.37□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 MPC1YGL080W 393 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YMR254CYMR254C 309 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YOR248WYOR248W 303 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YLL007CYLL007C 1998 nt0.36□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 snR83snR83 306 nt0.35□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 PRE4YFR050C 801 nt0.35□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 SCEIQ0160 708 nt0.35□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 GMC2YLR445W 567 nt0.35□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 BFR2YDR299W 1605 nt0.35□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 SWI6YLR182W 2412 nt0.34□□□□□ -2.35
LIP1Q03579 YCR100CYCR100C 951 nt0.34□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 PPN1YDR452W 2025 nt0.34□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 MRPL31YKL138C 396 nt0.34□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 SLI15YBR156C 2097 nt0.34□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 SPO13YHR014W 876 nt0.33□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 PAN2YGL094C 3348 nt0.33□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YAR009CYAR009C 3591 nt0.33□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 RFX1YLR176C 2436 nt0.33□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.32□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 PAM16YJL104W 450 nt0.32□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 TMA22YJR014W 597 nt0.32□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YBR063CYBR063C 1215 nt0.32□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YSP1YHR155W 3687 nt0.32□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 NPC2YDL046W 522 nt0.31□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YDL187CYDL187C 330 nt0.31□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 ECM9YKR004C 1134 nt0.31□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 RPL32YBL092W 393 nt0.31□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 GEA2YEL022W 4380 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 COG4YPR105C 2586 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 RTT102YGR275W 474 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YAL066WYAL066W 309 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YLR252WYLR252W 306 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YOR282WYOR282W 321 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 CHS6YJL099W 2241 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 SHE9YDR393W 1371 nt0.3□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 AFR1YDR085C 1863 nt0.29□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.29□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 RPL9AYGL147C 576 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 SPO11YHL022C 1197 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YHL042WYHL042W 453 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YJR087WYJR087W 351 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 AFB1YLR040C 675 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 RCN2YOR220W 798 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YPR039WYPR039W 336 nt0.28□□□□□ -2.36
LIP1Q03579 YJR003CYJR003C 1560 nt0.28□□□□□ -2.37
LIP1Q03579 PMP1YCR024C-A 123 nt0.27□□□□□ -2.37
LIP1Q03579 YDR250CYDR250C 276 nt0.27□□□□□ -2.37
LIP1Q03579 ABF2YMR072W 552 nt0.27□□□□□ -2.37
LIP1Q03579 LOA1YPR139C 903 nt0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.5 ms