Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPB1P53618 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 649.1 ms