Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 RPS24BYIL069C 408 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 MSH3YCR092C 3057 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF2P53277 MLH3YPL164C 2148 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF2P53277 AGA2YGL032C 264 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF2P53277 PHS1YJL097W 654 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YLR140WYLR140W 327 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF2P53277 LEE1YPL054W 906 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YPL182CYPL182C 384 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YLR434CYLR434C 384 nt1.17□□□□□ -2.22
SYF2P53277 RPL33BYOR234C 324 nt1.17□□□□□ -2.22
SYF2P53277 MSH5YDL154W 2706 nt1.17□□□□□ -2.22
SYF2P53277 HDA3YPR179C 1968 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YDL011CYDL011C 324 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 SWF1YDR126W 1011 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 HCH1YNL281W 462 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YOL159CYOL159C 516 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 FMP23YBR047W 528 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 YPL185WYPL185W 396 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 SWI5YDR146C 2130 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 LAA1YJL207C 6045 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 BUD3YCL014W 4911 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF2P53277 PXA2YKL188C 2562 nt1.15□□□□□ -2.22
SYF2P53277 SEC5YDR166C 2916 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YHR138CYHR138C 345 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YKL202WYKL202W 582 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF2P53277 RRT1YBL048W 312 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF2P53277 SAC3YDR159W 3906 nt1.15□□□□□ -2.23
SYF2P53277 SRP14YDL092W 441 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 CDC36YDL165W 576 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YDR269CYDR269C 324 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YGR265WYGR265W 411 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YBL073WYBL073W 312 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YBR285WYBR285W 435 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 ZRG17YNR039C 1818 nt1.14□□□□□ -2.23
SYF2P53277 EST2YLR318W 2655 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 RAD9YDR217C 3930 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YAP6YDR259C 1152 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YFL019CYFL019C 354 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 TIM13YGR181W 318 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YJL022WYJL022W 309 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 RPL26AYLR344W 384 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 RSM22YKL155C 1887 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 AZF1YOR113W 2745 nt1.13□□□□□ -2.23
SYF2P53277 ALK1YGL021W 2283 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 COF1YLL050C 432 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YOP1YPR028W 543 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 ADR1YDR216W 3972 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 NUP145YGL092W 3954 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 SPO23YBR250W 1572 nt1.12□□□□□ -2.23
SYF2P53277 MVP1YMR004W 1536 nt1.11□□□□□ -2.23
SYF2P53277 MAK10YEL053C 2202 nt1.11□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.11□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.11□□□□□ -2.23
SYF2P53277 MDS3YGL197W 4464 nt1.11□□□□□ -2.23
SYF2P53277 TRM732YMR259C 4263 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YJR029WYJR029W 5268 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 LYS14YDR034C 2373 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YAR047CYAR047C 321 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 ISF1YMR081C 1017 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 RPL9BYNL067W 576 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 HHT1YBR010W 411 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YOR376WYOR376W 369 nt1.1□□□□□ -2.23
SYF2P53277 SMC4YLR086W 4257 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF2P53277 PIP2YOR363C 2991 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YGR130CYGR130C 2451 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF2P53277 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF2P53277 CYC7YEL039C 342 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF2P53277 HIT1YJR055W 495 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF2P53277 BSC3YLR465C 309 nt1.09□□□□□ -2.23
SYF2P53277 PCF11YDR228C 1881 nt1.09□□□□□ -2.24
SYF2P53277 RTR1YER139C 681 nt1.08□□□□□ -2.24
SYF2P53277 RRT15YLR162W-A 189 nt1.08□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YML003WYML003W 873 nt1.08□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YOR053WYOR053W 342 nt1.08□□□□□ -2.24
SYF2P53277 KAP122YGL016W 3246 nt1.08□□□□□ -2.24
SYF2P53277 AIM9YER080W 1884 nt1.07□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YDR157WYDR157W 402 nt1.07□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.07□□□□□ -2.24
SYF2P53277 YHL041WYHL041W 450 nt1.07□□□□□ -2.24
SYF2P53277 VPS55YJR044C 423 nt1.07□□□□□ -2.24
SYF2P53277 DGR2YKL121W 2559 nt1.07□□□□□ -2.24
SYF2P53277 BEM2YER155C 6504 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 RFX1YLR176C 2436 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 TTI1YKL033W 3117 nt1.06□□□□□ -2.24
SYF2P53277 PAU2YEL049W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms