Protein–RNA interactions for Protein: P38722

YHL049C, Uncharacterized protein YHL049C, yeastyeast

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL049CP38722 MKT1YNL085W 2493 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 GDS1YOR355W 1569 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 SLX4YLR135W 2247 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 SRP14YDL092W 441 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YDL211CYDL211C 1119 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 VPS54YDR027C 2670 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 NUP188YML103C 4968 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 RAD9YDR217C 3930 nt1.06□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YDR114CYDR114C 303 nt1.05□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.05□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YER135CYER135C 393 nt1.05□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YLR269CYLR269C 351 nt1.05□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 VAM6YDL077C 3150 nt1.05□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 LYS14YDR034C 2373 nt1.05□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 SPO23YBR250W 1572 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YGL239CYGL239C 315 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 RPF1YHR088W 888 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YHR130CYHR130C 336 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 URM1YIL008W 300 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YML108WYML108W 318 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 HCH1YNL281W 462 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 GAL7YBR018C 1101 nt1.04□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 PIG1YLR273C 1947 nt1.03□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 NOC3YLR002C 1992 nt1.03□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 PRE4YFR050C 801 nt1.03□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 NBL1YHR199C-A 222 nt1.03□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 YPR063CYPR063C 423 nt1.03□□□□□ -2.24
YHL049CP38722 SEC3YER008C 4011 nt1.03□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YHR125WYHR125W 306 nt1.02□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.02□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YLL020CYLL020C 306 nt1.01□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YNL122CYNL122C 348 nt1.01□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 RPL32YBL092W 393 nt1.01□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 PXA2YKL188C 2562 nt1.01□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 SWI4YER111C 3282 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YER076W-AYER076W-A 348 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YER084W-AYER084W-A 513 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 RTR1YER139C 681 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 RTT102YGR275W 474 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 HIT1YJR055W 495 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 RPS27AYKL156W 249 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 snR14snR14 160 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YPL182CYPL182C 384 nt1□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 SAS3YBL052C 2496 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 NUT1YGL151W 3399 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 SPT21YMR179W 2277 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YCS4YLR272C 3531 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YNL303WYNL303W 348 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 PIP2YOR363C 2991 nt0.99□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 SLY1YDR189W 2001 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YJR029WYJR029W 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 AIM44YPL158C 2277 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YGR290WYGR290W 444 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YIL059CYIL059C 366 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 AIM29YKR074W 468 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 SDH2YLL041C 801 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.98□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 RFX1YLR176C 2436 nt0.97□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 APL1YJR005W 2103 nt0.97□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 YGR045CYGR045C 363 nt0.97□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 CLU1YMR012W 3834 nt0.97□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 RUF22RUF22 515 nt0.97□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 NUT2YPR168W 474 nt0.97□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 MPT5YGL178W 2580 nt0.97□□□□□ -2.25
YHL049CP38722 CDC39YCR093W 6327 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 EAF1YDR359C 2949 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 YLL032CYLL032C 2478 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 SCC2YDR180W 4482 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 YDR269CYDR269C 324 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 BI2Q0110 1272 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 ECL1YGR146C 636 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 PHS1YJL097W 654 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 snR54snR54 86 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 NUP145YGL092W 3954 nt0.96□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 EFR3YMR212C 2349 nt0.95□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 NFU1YKL040C 771 nt0.95□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 ERP4YOR016C 624 nt0.95□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 PAU24YBR301W 363 nt0.95□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 SCW11YGL028C 1629 nt0.95□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 MRPL31YKL138C 396 nt0.94□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 YLR171WYLR171W 390 nt0.94□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 CDC33YOL139C 642 nt0.94□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 NST1YNL091W 3723 nt0.93□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 APL2YKL135C 2181 nt0.93□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 TIM13YGR181W 318 nt0.93□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 UPS1YLR193C 528 nt0.93□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 ENV11YGR071C 2583 nt0.92□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 APL3YBL037W 3078 nt0.92□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 FYV7YLR068W 456 nt0.92□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 ZEO1YOL109W 342 nt0.92□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 YBR012CYBR012C 420 nt0.92□□□□□ -2.26
YHL049CP38722 DOP1YDR141C 5097 nt0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms