Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	SEF1	YBL066C	3447 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	QCR7	YDR529C	384 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YER121W	YER121W	345 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YKL063C	YKL063C	504 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	TBS1	YBR150C	3285 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	FYV8	YGR196C	2454 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	NUP120	YKL057C	3114 nt		1.32	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	MAD1	YGL086W	2250 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	SPO75	YLL005C	2607 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	BST1	YFL025C	3090 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YDR169C-A	YDR169C-A	150 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	RPS24B	YIL069C	408 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	TMA22	YJR014W	597 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YPR012W	YPR012W	255 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	KCS1	YDR017C	3153 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	SPC110	YDR356W	2835 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	TTI1	YKL033W	3117 nt		1.31	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	AHC1	YOR023C	1701 nt		1.3	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	tV(UAC)B	tV(UAC)B	74 nt		1.3	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	tV(UAC)D	tV(UAC)D	74 nt		1.3	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YAR047C	YAR047C	321 nt		1.3	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	RPS18B	YML026C	441 nt		1.3	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YBL071C	YBL071C	309 nt		1.3	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	MON2	YNL297C	4911 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	Q0142	Q0142	177 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	RPL42B	YHR141C	321 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	FCF2	YLR051C	654 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	RPL42A	YNL162W	321 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	MRPL50	YNR022C	420 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YOR053W	YOR053W	342 nt		1.29	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	YGR265W	YGR265W	411 nt		1.28	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	ABM1	YJR108W	372 nt		1.28	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	RPL26A	YLR344W	384 nt		1.28	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	APL2	YKL135C	2181 nt		1.28	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	POL5	YEL055C	3069 nt		1.28	□□□□□ -2.2
ATG12	P38316	TRM732	YMR259C	4263 nt		1.28	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	MDS3	YGL197W	4464 nt		1.28	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	IRR1	YIL026C	3453 nt		1.27	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	NCA2	YPR155C	1851 nt		1.27	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	DIE2	YGR227W	1578 nt		1.27	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	OSH6	YKR003W	1347 nt		1.27	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YHL009W-A	YHL009W-A	1242 nt		1.27	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	PHS1	YJL097W	654 nt		1.27	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	BSC3	YLR465C	309 nt		1.27	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	HIT1	YJR055W	495 nt		1.26	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	HHT1	YBR010W	411 nt		1.26	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YBR012C	YBR012C	420 nt		1.26	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YPL185W	YPL185W	396 nt		1.26	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	COG4	YPR105C	2586 nt		1.26	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YDL152W	YDL152W	366 nt		1.25	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YAP6	YDR259C	1152 nt		1.25	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		1.25	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YML009C-A	YML009C-A	327 nt		1.25	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YGR109W-B	YGR109W-B	4644 nt		1.24	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	SIP4	YJL089W	2490 nt		1.24	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		1.24	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		1.24	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	RPL32	YBL092W	393 nt		1.24	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YPR099C	YPR099C	357 nt		1.24	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	HKR1	YDR420W	5409 nt		1.24	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YAR009C	YAR009C	3591 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	EMC5	YIL027C	426 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YJL015C	YJL015C	285 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YLR140W	YLR140W	327 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	ISF1	YMR081C	1017 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YNL114C	YNL114C	372 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	RPL33B	YOR234C	324 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	MSH5	YDL154W	2706 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	MYO1	YHR023W	5787 nt		1.23	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	PCF11	YDR228C	1881 nt		1.22	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	YPL225W	YPL225W	441 nt		1.22	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	SEC5	YDR166C	2916 nt		1.22	□□□□□ -2.21
ATG12	P38316	HDA3	YPR179C	1968 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	TOF2	YKR010C	2316 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YJL022W	YJL022W	309 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	COF1	YLL050C	432 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	CLU1	YMR012W	3834 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YOR121C	YOR121C	306 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YCL046W	YCL046W	324 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	PAN3	YKL025C	2040 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	ZRG17	YNR039C	1818 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YNL284C-B	YNL284C-B	5268 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	SWI5	YDR146C	2130 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	MLH3	YPL164C	2148 nt		1.21	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YOR029W	YOR029W	336 nt		1.2	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	ZIP1	YDR285W	2628 nt		1.2	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	ALK1	YGL021W	2283 nt		1.2	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	EST2	YLR318W	2655 nt		1.2	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	SEC21	YNL287W	2808 nt		1.2	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YDL011C	YDL011C	324 nt		1.19	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YGL239C	YGL239C	315 nt		1.19	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YHL041W	YHL041W	450 nt		1.19	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YJL020W-A	YJL020W-A	258 nt		1.19	□□□□□ -2.22

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