Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VPREB3Q9UKI3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms