Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDKN3Q16667 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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