Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 RPL42BYHR141C 321 nt1.92□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.92□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 CGI121YML036W 546 nt1.92□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 RPL42AYNL162W 321 nt1.92□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 CFT2YLR115W 2580 nt1.92□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 ADR1YDR216W 3972 nt1.91□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 HCS1YKL017C 2052 nt1.91□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 BTT1YDR252W 450 nt1.91□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 RPL32YBL092W 393 nt1.91□□□□□ -2.1
AVL9Q12500 YAR047CYAR047C 321 nt1.9□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YLR334CYLR334C 381 nt1.9□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 LHS1YKL073W 2646 nt1.9□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 AGC1YPR021C 2709 nt1.89□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YDR008CYDR008C 351 nt1.89□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 RPL9BYNL067W 576 nt1.89□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YNL114CYNL114C 372 nt1.89□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 UBR2YLR024C 5619 nt1.89□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YJR098CYJR098C 1971 nt1.89□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 TIM13YGR181W 318 nt1.88□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 VPS34YLR240W 2628 nt1.88□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.87□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.87□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.87□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 PHS1YJL097W 654 nt1.87□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YCL023CYCL023C 348 nt1.87□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 RTP1YMR185W 2946 nt1.87□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.86□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.86□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.86□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 DFG16YOR030W 1860 nt1.86□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 HSH155YMR288W 2916 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 snR56snR56 88 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 ATG31YDR022C 591 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YAP6YDR259C 1152 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 MCM22YJR135C 720 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 RPS27AYKL156W 249 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 PAU18YLL064C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 RPL26AYLR344W 384 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 HCH1YNL281W 462 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 PAU6YNR076W 363 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 GUP1YGL084C 1683 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 HIR3YJR140C 4947 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 TFC8YPL007C 1767 nt1.85□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 PCF11YDR228C 1881 nt1.84□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YML003WYML003W 873 nt1.84□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.84□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 YOR121CYOR121C 306 nt1.84□□□□□ -2.11
AVL9Q12500 PEX8YGR077C 1770 nt1.84□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 TDA9YML081W 3756 nt1.84□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 AIM9YER080W 1884 nt1.84□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YGR250CYGR250C 2346 nt1.83□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 MSC6YOR354C 2079 nt1.83□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 HIT1YJR055W 495 nt1.83□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 ISF1YMR081C 1017 nt1.83□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YBL073WYBL073W 312 nt1.83□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YCL046WYCL046W 324 nt1.83□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 HDA3YPR179C 1968 nt1.83□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 MYO4YAL029C 4416 nt1.82□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 ABM1YJR108W 372 nt1.82□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YKL083WYKL083W 615 nt1.82□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 FMP23YBR047W 528 nt1.82□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YPL261CYPL261C 309 nt1.82□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 OSH6YKR003W 1347 nt1.82□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 BRR2YER172C 6492 nt1.82□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 SEC63YOR254C 1992 nt1.81□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.81□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 SWI5YDR146C 2130 nt1.81□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 LRE1YCL051W 1752 nt1.81□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 ATP6Q0085 780 nt1.81□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 HHT1YBR010W 411 nt1.81□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 PKH3YDR466W 2697 nt1.81□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 REV3YPL167C 4515 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 PRE4YFR050C 801 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YPL229WYPL229W 621 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 CFT1YDR301W 4074 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 SEY1YOR165W 2331 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YJR039WYJR039W 3366 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 PXA2YKL188C 2562 nt1.8□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 CTR9YOL145C 3234 nt1.79□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YGR265WYGR265W 411 nt1.79□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 IRC20YLR247C 4671 nt1.79□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 ZRG17YNR039C 1818 nt1.79□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.79□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 IRE1YHR079C 3348 nt1.78□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.78□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.78□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YOR029WYOR029W 336 nt1.78□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YBR012CYBR012C 420 nt1.78□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 SAR1YPL218W 573 nt1.78□□□□□ -2.12
AVL9Q12500 YNL144CYNL144C 2223 nt1.78□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 RLM1YPL089C 2031 nt1.78□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 NOP53YPL146C 1368 nt1.77□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YOR093CYOR093C 4947 nt1.77□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 GIM4YEL003W 336 nt1.77□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.77□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 MSH5YDL154W 2706 nt1.77□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 UTP21YLR409C 2820 nt1.76□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 PAU3YCR104W 375 nt1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms