Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YOR146WYOR146W 306 nt1.61□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 SPO24YPR036W-A 204 nt1.61□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 MSS11YMR164C 2277 nt1.61□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 MNL2YLR057W 2550 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 RPL31AYDL075W 342 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 YHR138CYHR138C 345 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 YLR434CYLR434C 384 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 YOL159CYOL159C 516 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 GPX2YBR244W 489 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 IRE1YHR079C 3348 nt1.6□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 NOP53YPL146C 1368 nt1.59□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 SBE22YHR103W 2559 nt1.59□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 ZRG8YER033C 3231 nt1.59□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 YDR269CYDR269C 324 nt1.59□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 SDH7YDR511W 402 nt1.59□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 TRX1YLR043C 312 nt1.59□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 YLR287CYLR287C 1068 nt1.59□□□□□ -2.15
LDB17Q12342 HIR3YJR140C 4947 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YDL152WYDL152W 366 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 SWF1YDR126W 1011 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 MRPL50YNR022C 420 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YPR099CYPR099C 357 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 SLM1YIL105C 2061 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 TRM3YDL112W 4311 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 MON2YNL297C 4911 nt1.58□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YSW1YBR148W 1830 nt1.57□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 RTT102YGR275W 474 nt1.57□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 RPS24BYIL069C 408 nt1.57□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YKL063CYKL063C 504 nt1.57□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YBL071CYBL071C 309 nt1.57□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 KCS1YDR017C 3153 nt1.56□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 MCM22YJR135C 720 nt1.56□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 PEP3YLR148W 2757 nt1.56□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 SKI3YPR189W 4299 nt1.56□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YBP1YBR216C 2025 nt1.56□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 RKM1YPL208W 1752 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YCR043CYCR043C 384 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 IES5YER092W 378 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 PGA1YNL158W 597 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 RPL32YBL092W 393 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 FRK1YPL141C 2598 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 DAS1YJL149W 1992 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 SXM1YDR395W 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 CTF4YPR135W 2784 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 DOT6YER088C 2013 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 PAN3YKL025C 2040 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YIL102CYIL102C 306 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 YBR285WYBR285W 435 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 SNF5YBR289W 2718 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 DIE2YGR227W 1578 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 MDM20YOL076W 2391 nt1.54□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 MEC1YBR136W 7107 nt1.53□□□□□ -2.16
LDB17Q12342 SEF1YBL066C 3447 nt1.53□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 PHS1YJL097W 654 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 PFD1YJL179W 330 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 HCH1YNL281W 462 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YBR174CYBR174C 315 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YGR250CYGR250C 2346 nt1.52□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YDR157WYDR157W 402 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YGL239CYGL239C 315 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 RPL42BYHR141C 321 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 RPL42AYNL162W 321 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YPL185WYPL185W 396 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YCL046WYCL046W 324 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 HMI1YOL095C 2121 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 SPO23YBR250W 1572 nt1.51□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YDR008CYDR008C 351 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 PAU18YLL064C 363 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 RPL26AYLR344W 384 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 CGI121YML036W 546 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 PAU6YNR076W 363 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 CDC31YOR257W 486 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 SMY1YKL079W 1971 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 POL5YEL055C 3069 nt1.5□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 CTR9YOL145C 3234 nt1.49□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 SPC110YDR356W 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 BST1YFL025C 3090 nt1.49□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 CHS1YNL192W 3396 nt1.49□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 OSH6YKR003W 1347 nt1.49□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YBR184WYBR184W 1572 nt1.49□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 GNT1YOR320C 1476 nt1.49□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 CCH1YGR217W 6120 nt1.48□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 ATG31YDR022C 591 nt1.48□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YAP6YDR259C 1152 nt1.48□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 BSC3YLR465C 309 nt1.48□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YNL114CYNL114C 372 nt1.48□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YOR053WYOR053W 342 nt1.48□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YJR098CYJR098C 1971 nt1.48□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 MSC6YOR354C 2079 nt1.47□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 MDS3YGL197W 4464 nt1.47□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.47□□□□□ -2.17
LDB17Q12342 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.47□□□□□ -2.17
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