Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 NBP1YLR457C 960 nt0.97□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.97□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 IRC23YOR044W 474 nt0.97□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 NUP145YGL092W 3954 nt0.97□□□□□ -2.25
RUD3Q12234 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.96□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YPT6YLR262C 648 nt0.96□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 COX7YMR256C 183 nt0.96□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 SAS3YBL052C 2496 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YGL230CYGL230C 444 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YGR115CYGR115C 780 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 TIM10YHR005C-A 282 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 LRP1YHR081W 555 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 SWS2YNL081C 432 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YPL197CYPL197C 414 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 POP7YBR167C 423 nt0.95□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YDL152WYDL152W 366 nt0.94□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 PRM8YGL053W 714 nt0.94□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 MPC1YGL080W 393 nt0.94□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 VAM3YOR106W 852 nt0.94□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 PAU24YBR301W 363 nt0.93□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 BI4Q0120 1917 nt0.93□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 SNO3YFL060C 669 nt0.92□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YGL109WYGL109W 324 nt0.92□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.92□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 SNO2YNL334C 669 nt0.92□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 BUD3YCL014W 4911 nt0.92□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.91□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YOP1YPR028W 543 nt0.91□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 CDC24YAL041W 2565 nt0.91□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YAR009CYAR009C 3591 nt0.9□□□□□ -2.26
RUD3Q12234 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.9□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 AIM9YER080W 1884 nt0.9□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 NOC3YLR002C 1992 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 SHE9YDR393W 1371 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 snR5snR5 204 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 SRP14YDL092W 441 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YDR220CYDR220C 294 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YGR045CYGR045C 363 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YKL111CYKL111C 336 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YBR012CYBR012C 420 nt0.89□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 UBP3YER151C 2739 nt0.88□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 ZIP1YDR285W 2628 nt0.88□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 SWI5YDR146C 2130 nt0.88□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 SDS22YKL193C 1017 nt0.88□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 TOF2YKR010C 2316 nt0.88□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 MPT5YGL178W 2580 nt0.88□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 CYC7YEL039C 342 nt0.87□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YPR096CYPR096C 303 nt0.87□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 PIG1YLR273C 1947 nt0.87□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 NUP157YER105C 4176 nt0.87□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 UTP13YLR222C 2454 nt0.87□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 QCR7YDR529C 384 nt0.86□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YGL015CYGL015C 393 nt0.86□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YGR228WYGR228W 345 nt0.86□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 RPC10YHR143W-A 213 nt0.86□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YLR366WYLR366W 306 nt0.86□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.86□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YDL073WYDL073W 2955 nt0.85□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 APL2YKL135C 2181 nt0.85□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 SET3YKR029C 2256 nt0.84□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 HNT1YDL125C 477 nt0.84□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 RPL16AYIL133C 600 nt0.84□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YLR271WYLR271W 825 nt0.84□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YPR099CYPR099C 357 nt0.84□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 NUT2YPR168W 474 nt0.84□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YCL002CYCL002C 792 nt0.84□□□□□ -2.27
RUD3Q12234 YDR509WYDR509W 348 nt0.83□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 NBL1YHR199C-A 222 nt0.83□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 SEC1YDR164C 2175 nt0.83□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YAP3YHL009C 993 nt0.82□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 RUF22RUF22 515 nt0.82□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 MKT1YNL085W 2493 nt0.81□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 CSM4YPL200W 471 nt0.81□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.81□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 PAN3YKL025C 2040 nt0.81□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YCR100CYCR100C 951 nt0.8□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YDR008CYDR008C 351 nt0.8□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.8□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.8□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 AIM44YPL158C 2277 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 MND1YGL183C 660 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 PAM16YJL104W 450 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 HIT1YJR055W 495 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YOR199WYOR199W 330 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 PRP16YKR086W 3216 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 SPO23YBR250W 1572 nt0.79□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YDL206WYDL206W 2289 nt0.78□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 RIM20YOR275C 1986 nt0.78□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 YDR114CYDR114C 303 nt0.78□□□□□ -2.28
RUD3Q12234 SEM1YDR363W-A 270 nt0.77□□□□□ -2.29
RUD3Q12234 MXR1YER042W 555 nt0.77□□□□□ -2.29
RUD3Q12234 TMA22YJR014W 597 nt0.77□□□□□ -2.29
RUD3Q12234 YBR071WYBR071W 636 nt0.77□□□□□ -2.29
RUD3Q12234 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
RUD3Q12234 STO1YMR125W 2586 nt0.77□□□□□ -2.29
RUD3Q12234 ALY2YJL084C 3141 nt0.77□□□□□ -2.29
RUD3Q12234 LYS14YDR034C 2373 nt0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.5 ms