Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 MSH6YDR097C 3729 nt1.62□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 PAU3YCR104W 375 nt1.61□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.61□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 FCF2YLR051C 654 nt1.61□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.61□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 CLU1YMR012W 3834 nt1.61□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 BTT1YDR252W 450 nt1.6□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.6□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.6□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.6□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 PGA1YNL158W 597 nt1.6□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 IRE1YHR079C 3348 nt1.6□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 SPO75YLL005C 2607 nt1.59□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 CRG1YHR209W 876 nt1.59□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 TMA22YJR014W 597 nt1.59□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 CDC33YOL139C 642 nt1.59□□□□□ -2.15
SLM3Q12093 ZRG8YER033C 3231 nt1.59□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 SIP4YJL089W 2490 nt1.59□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 CFT2YLR115W 2580 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 OST1YJL002C 1431 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 ATG9YDL149W 2994 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 HUR1YGL168W 333 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YJL007CYJL007C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 TMA7YLR262C-A 195 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YBR032WYBR032W 303 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YPL205CYPL205C 345 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 TUS1YLR425W 3924 nt1.58□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 TFC8YPL007C 1767 nt1.57□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.57□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 TIF11YMR260C 462 nt1.57□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.57□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 SAC3YDR159W 3906 nt1.57□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 SWT1YOR166C 1377 nt1.57□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YCR043CYCR043C 384 nt1.56□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.56□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 VPS20YMR077C 666 nt1.56□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YLR419WYLR419W 4308 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 POL5YEL055C 3069 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 QCR7YDR529C 384 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 RPL42BYHR141C 321 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 INA22YIR024C 651 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YJL015CYJL015C 285 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YLR101CYLR101C 396 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 RPL42AYNL162W 321 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 SEC63YOR254C 1992 nt1.55□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 FRK1YPL141C 2598 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 PKH3YDR466W 2697 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 DAS1YJL149W 1992 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 KCS1YDR017C 3153 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 URM1YIL008W 300 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 CGI121YML036W 546 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 FMP23YBR047W 528 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YPL238CYPL238C 390 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 MMS22YLR320W 4365 nt1.54□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 RPA34YJL148W 702 nt1.53□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YKL063CYKL063C 504 nt1.53□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 ZEO1YOL109W 342 nt1.53□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 YPR099CYPR099C 357 nt1.53□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 BPH1YCR032W 6504 nt1.53□□□□□ -2.16
SLM3Q12093 VPS54YDR027C 2670 nt1.53□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 PAN3YKL025C 2040 nt1.51□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 CTR9YOL145C 3234 nt1.51□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 QCR9YGR183C 201 nt1.51□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.51□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 DFG16YOR030W 1860 nt1.51□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YGR250CYGR250C 2346 nt1.51□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 TOF2YKR010C 2316 nt1.51□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.5□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.5□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.5□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YPR117WYPR117W 7470 nt1.5□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YDL152WYDL152W 366 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YER135CYER135C 393 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 NFU1YKL040C 771 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YLR287CYLR287C 1068 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 HCH1YNL281W 462 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YNL324WYNL324W 396 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 HMI1YOL095C 2121 nt1.49□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 NOP53YPL146C 1368 nt1.48□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 GDS1YOR355W 1569 nt1.48□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.48□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YJR157WYJR157W 363 nt1.48□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YBL073WYBL073W 312 nt1.48□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 DIE2YGR227W 1578 nt1.47□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 SWI5YDR146C 2130 nt1.47□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 ERP4YOR016C 624 nt1.47□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 RPL33BYOR234C 324 nt1.47□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 YPL182CYPL182C 384 nt1.47□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 VPS15YBR097W 4365 nt1.47□□□□□ -2.17
SLM3Q12093 SKI3YPR189W 4299 nt1.46□□□□□ -2.18
SLM3Q12093 HIR3YJR140C 4947 nt1.46□□□□□ -2.18
SLM3Q12093 RPS27AYKL156W 249 nt1.46□□□□□ -2.18
SLM3Q12093 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.46□□□□□ -2.18
SLM3Q12093 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.46□□□□□ -2.18
SLM3Q12093 ISF1YMR081C 1017 nt1.46□□□□□ -2.18
SLM3Q12093 YNL114CYNL114C 372 nt1.46□□□□□ -2.18
SLM3Q12093 YBL071CYBL071C 309 nt1.46□□□□□ -2.18
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