Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 KIP1YBL063W 3336 nt1.88□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 TBS1YBR150C 3285 nt1.88□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 RPA34YJL148W 702 nt1.88□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 TMA7YLR262C-A 195 nt1.88□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YBL071CYBL071C 309 nt1.88□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 RTT102YGR275W 474 nt1.87□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YOR146WYOR146W 306 nt1.87□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 SEC63YOR254C 1992 nt1.87□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YDR008CYDR008C 351 nt1.86□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 RPS24BYIL069C 408 nt1.86□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YNL114CYNL114C 372 nt1.86□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.86□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 MYO4YAL029C 4416 nt1.86□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 TFC8YPL007C 1767 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YJR098CYJR098C 1971 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 SAC3YDR159W 3906 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YER079WYER079W 633 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 RPL42BYHR141C 321 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YBL073WYBL073W 312 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 RPL42AYNL162W 321 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 HIR3YJR140C 4947 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YGR250CYGR250C 2346 nt1.85□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YJR039WYJR039W 3366 nt1.84□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 MSC6YOR354C 2079 nt1.84□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 SEY1YOR165W 2331 nt1.84□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 MSH6YDR097C 3729 nt1.84□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.84□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 ABM1YJR108W 372 nt1.84□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.84□□□□□ -2.11
RIM20Q12033 AGC1YPR021C 2709 nt1.84□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.83□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YOL159CYOL159C 516 nt1.83□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 LEE1YPL054W 906 nt1.83□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YPL185WYPL185W 396 nt1.83□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YDL011CYDL011C 324 nt1.82□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 RPL32YBL092W 393 nt1.82□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 CTR9YOL145C 3234 nt1.81□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YGR265WYGR265W 411 nt1.81□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 PAU18YLL064C 363 nt1.81□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 PAU6YNR076W 363 nt1.81□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 FMP23YBR047W 528 nt1.81□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 DFG16YOR030W 1860 nt1.81□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 IRC20YLR247C 4671 nt1.81□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 CAT8YMR280C 4302 nt1.8□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 LRE1YCL051W 1752 nt1.8□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 WIP1YDR374W-A 270 nt1.8□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YHR138CYHR138C 345 nt1.8□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 MCM22YJR135C 720 nt1.8□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YNL144CYNL144C 2223 nt1.8□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 HSL1YKL101W 4557 nt1.79□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 HDA3YPR179C 1968 nt1.79□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 UTP21YLR409C 2820 nt1.79□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YDR269CYDR269C 324 nt1.79□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 RLM1YPL089C 2031 nt1.79□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 HSH155YMR288W 2916 nt1.79□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 MSH5YDL154W 2706 nt1.78□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 MDM20YOL076W 2391 nt1.78□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 SWF1YDR126W 1011 nt1.78□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 PFD1YJL179W 330 nt1.78□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YLR434CYLR434C 384 nt1.78□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 YCL046WYCL046W 324 nt1.78□□□□□ -2.12
RIM20Q12033 IRE1YHR079C 3348 nt1.78□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 NOP53YPL146C 1368 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 OSH6YKR003W 1347 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 PRE4YFR050C 801 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 TIM13YGR181W 318 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YOR053WYOR053W 342 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 ZRG17YNR039C 1818 nt1.77□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 SFB2YNL049C 2631 nt1.76□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YDR157WYDR157W 402 nt1.76□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.76□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 HHT1YBR010W 411 nt1.76□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YBR285WYBR285W 435 nt1.76□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 ADR1YDR216W 3972 nt1.76□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 SPO23YBR250W 1572 nt1.76□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YIL102CYIL102C 306 nt1.75□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 PHS1YJL097W 654 nt1.75□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 RPL9BYNL067W 576 nt1.75□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 PKH3YDR466W 2697 nt1.75□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 SWI5YDR146C 2130 nt1.75□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YBP1YBR216C 2025 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 MAK10YEL053C 2202 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 MEC1YBR136W 7107 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YHL037CYHL037C 402 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 RPS27AYKL156W 249 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 BSC3YLR465C 309 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YML003WYML003W 873 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 CDC31YOR257W 486 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 PXA2YKL188C 2562 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 PMD1YER132C 5262 nt1.74□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 PAU3YCR104W 375 nt1.73□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 YAR047CYAR047C 321 nt1.73□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 AIM9YER080W 1884 nt1.73□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 KCS1YDR017C 3153 nt1.73□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 LHS1YKL073W 2646 nt1.72□□□□□ -2.13
RIM20Q12033 SKI3YPR189W 4299 nt1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms