Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.74□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 NUP192YJL039C 5052 nt1.74□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YDR341CYDR341C 1824 nt1.73□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 MZM1YDR493W 372 nt1.73□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.73□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.73□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.73□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 VPS35YJL154C 2835 nt1.73□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 TBS1YBR150C 3285 nt1.72□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 MYO4YAL029C 4416 nt1.72□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.72□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 TMA7YLR262C-A 195 nt1.72□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 RPS18BYML026C 441 nt1.72□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.71□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.71□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 QCR7YDR529C 384 nt1.71□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YJR011CYJR011C 786 nt1.71□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 RPL26AYLR344W 384 nt1.71□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 KAR3YPR141C 2190 nt1.71□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YHR210CYHR210C 1026 nt1.7□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.7□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YAF9YNL107W 681 nt1.7□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 MSS11YMR164C 2277 nt1.7□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 HCS1YKL017C 2052 nt1.7□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 UBR2YLR024C 5619 nt1.7□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 AGC1YPR021C 2709 nt1.69□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 HSL1YKL101W 4557 nt1.69□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 RIC1YLR039C 3171 nt1.69□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 FCF2YLR051C 654 nt1.69□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 HCH1YNL281W 462 nt1.69□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YOR093CYOR093C 4947 nt1.69□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 NAM7YMR080C 2916 nt1.69□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 SBE22YHR103W 2559 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 CDC27YBL084C 2277 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YDL062WYDL062W 426 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 RPL40BYKR094C 387 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 ISF1YMR081C 1017 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YNL146WYNL146W 303 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 SNC2YOR327C 348 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 STB4YMR019W 2850 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YJR003CYJR003C 1560 nt1.68□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 CYB5YNL111C 363 nt1.67□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 TIM18YOR297C 579 nt1.67□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 RPH1YER169W 2391 nt1.67□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 SOK2YMR016C 2358 nt1.67□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 DFG16YOR030W 1860 nt1.67□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 BRR2YER172C 6492 nt1.66□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 YDL011CYDL011C 324 nt1.66□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 PCF11YDR228C 1881 nt1.66□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 MSH6YDR097C 3729 nt1.65□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 VMR1YHL035C 4779 nt1.65□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 DCP2YNL118C 2913 nt1.65□□□□□ -2.14
YPQ1Q12010 NHP2YDL208W 471 nt1.65□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 ABM1YJR108W 372 nt1.65□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YAR053WYAR053W 297 nt1.65□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 RPL9BYNL067W 576 nt1.65□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YBL073WYBL073W 312 nt1.65□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 PLC1YPL268W 2610 nt1.65□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YMR045CYMR045C 5268 nt1.65□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 RTP1YMR185W 2946 nt1.64□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.64□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.64□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 PGA1YNL158W 597 nt1.64□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 CDC31YOR257W 486 nt1.64□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 SEY1YOR165W 2331 nt1.64□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 PET309YLR067C 2898 nt1.64□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YDR102CYDR102C 333 nt1.63□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YGL069CYGL069C 465 nt1.63□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 HSK3YKL138C-A 210 nt1.63□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 IRC23YOR044W 474 nt1.63□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 DOT6YER088C 2013 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YJR039WYJR039W 3366 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YNL144CYNL144C 2223 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YGL239CYGL239C 315 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 RPL32YBL092W 393 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YPR099CYPR099C 357 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YSY6YBR162W-A 198 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 CAT8YMR280C 4302 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.62□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YER097WYER097W 330 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 PHS1YJL097W 654 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YKL118WYKL118W 312 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YKL136WYKL136W 399 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 SGD1YLR336C 2700 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 CHC1YGL206C 4962 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 SEC63YOR254C 1992 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YLR149CYLR149C 2193 nt1.61□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YDR413CYDR413C 576 nt1.6□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.6□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.6□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YPL182CYPL182C 384 nt1.6□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YBR224WYBR224W 516 nt1.6□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 PKH3YDR466W 2697 nt1.6□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 BPH1YCR032W 6504 nt1.6□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 NOT5YPR072W 1683 nt1.59□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YDL152WYDL152W 366 nt1.59□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 CSN9YDR179C 489 nt1.59□□□□□ -2.15
YPQ1Q12010 YKL083WYKL083W 615 nt1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.8 ms