Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 PAM16YJL104W 450 nt0.63□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 RPL37AYLR185W 267 nt0.63□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.63□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 RPL42AYNL162W 321 nt0.63□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YPR147CYPR147C 915 nt0.63□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 AIM9YER080W 1884 nt0.63□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 SMB1YER029C 591 nt0.62□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YNL150WYNL150W 408 nt0.62□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YBR012CYBR012C 420 nt0.62□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 SEC1YDR164C 2175 nt0.62□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 NHP2YDL208W 471 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 CWC23YGL128C 852 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 NBP1YLR457C 960 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YOP1YPR028W 543 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 UTP13YLR222C 2454 nt0.61□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YDR521WYDR521W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 CYC7YEL039C 342 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 TAD1YGL243W 1203 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 TIM10YHR005C-A 282 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 CMC4YMR194C-B 222 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 COG4YPR105C 2586 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YCL020WYCL020W 1317 nt0.6□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 SET3YKR029C 2256 nt0.59□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YFR057WYFR057W 456 nt0.59□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 LRP1YHR081W 555 nt0.59□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 RPL16AYIL133C 600 nt0.59□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.59□□□□□ -2.31
HRD1Q08109 ALY2YJL084C 3141 nt0.59□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 PIG1YLR273C 1947 nt0.58□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 RRI2YOL117W 1938 nt0.58□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 snR79snR79 84 nt0.58□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 TMA22YJR014W 597 nt0.58□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 HIT1YJR055W 495 nt0.58□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.58□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 MRPL32YCR003W 552 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 QCR7YDR529C 384 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 COX7YMR256C 183 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 RUF22RUF22 515 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YOR199WYOR199W 330 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 UBS1YBR165W 834 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 POP7YBR167C 423 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 ENV11YGR071C 2583 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 RIM20YOR275C 1986 nt0.57□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 TOF2YKR010C 2316 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 GPM2YDL021W 936 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 SRP14YDL092W 441 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YDR008CYDR008C 351 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YDR509WYDR509W 348 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 SPC2YML055W 537 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YPL197CYPL197C 414 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 NUT2YPR168W 474 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 KAR1YNL188W 1302 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 APL2YKL135C 2181 nt0.56□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 MPT5YGL178W 2580 nt0.55□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YPT6YLR262C 648 nt0.55□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 NOC3YLR002C 1992 nt0.55□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YDL196WYDL196W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 SWF1YDR126W 1011 nt0.54□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 PRE4YFR050C 801 nt0.54□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 RPC10YHR143W-A 213 nt0.54□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 SPO23YBR250W 1572 nt0.53□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.53□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 VAM3YOR106W 852 nt0.53□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 YPR099CYPR099C 357 nt0.53□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 BI4Q0120 1917 nt0.53□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 SLD3YGL113W 2007 nt0.53□□□□□ -2.32
HRD1Q08109 RKR1YMR247C 4689 nt0.53□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 SWI5YDR146C 2130 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 MKT1YNL085W 2493 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 MXR1YER042W 555 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YGL109WYGL109W 324 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 CSM4YPL200W 471 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 PXA2YKL188C 2562 nt0.52□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.9 ms