Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 GIP3YPL137C 3831 nt1.97□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 SAP190YKR028W 3102 nt1.97□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 RGA1YOR127W 3024 nt1.96□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 GUP1YGL084C 1683 nt1.96□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 SMY1YKL079W 1971 nt1.96□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 MNE1YOR350C 1992 nt1.96□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 PAC1YOR269W 1485 nt1.96□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 SGO1YOR073W 1773 nt1.96□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 RKM1YPL208W 1752 nt1.95□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 MNL2YLR057W 2550 nt1.95□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 CSN9YDR179C 489 nt1.95□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 PRE4YFR050C 801 nt1.95□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 MAM33YIL070C 801 nt1.95□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 RPS27AYKL156W 249 nt1.95□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 MMS22YLR320W 4365 nt1.94□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YMR045CYMR045C 5268 nt1.94□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YFL032WYFL032W 321 nt1.94□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.94□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 BRE1YDL074C 2103 nt1.94□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 SEC31YDL195W 3822 nt1.94□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 APL5YPL195W 2799 nt1.93□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 ALK2YBL009W 2031 nt1.93□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 DFG16YOR030W 1860 nt1.93□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 IRR1YIL026C 3453 nt1.93□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 NEO1YIL048W 3456 nt1.93□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YCR043CYCR043C 384 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 RPL35AYDL191W 363 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YHL041WYHL041W 450 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 VPS8YAL002W 3825 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YLR053CYLR053C 327 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YNL114CYNL114C 372 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 snR36snR36 182 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 SNF5YBR289W 2718 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 SLM1YIL105C 2061 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 COS111YBR203W 2775 nt1.92□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 PEX8YGR077C 1770 nt1.91□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 VTC1YER072W 390 nt1.91□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 RPL42BYHR141C 321 nt1.91□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.91□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 RPL42AYNL162W 321 nt1.91□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 HHT1YBR010W 411 nt1.91□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 VPS34YLR240W 2628 nt1.91□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 FKS1YLR342W 5631 nt1.9□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 VPH1YOR270C 2523 nt1.9□□□□□ -2.1
SSK1Q07084 YDL062WYDL062W 426 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YER181CYER181C 324 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YIL059CYIL059C 366 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 TRL1YJL087C 2484 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 OSH6YKR003W 1347 nt1.9□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 GCN2YDR283C 4980 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 CHC1YGL206C 4962 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 RTT107YHR154W 3213 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 UTP22YGR090W 3714 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 NOP53YPL146C 1368 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YDL118WYDL118W 381 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 GCN4YEL009C 846 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 SAR1YPL218W 573 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 PXA2YKL188C 2562 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 GRR1YJR090C 3456 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 ZRG8YER033C 3231 nt1.89□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 ATP7YKL016C 525 nt1.88□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.88□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 PLC1YPL268W 2610 nt1.88□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 TOR2YKL203C 7425 nt1.88□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 TUS1YLR425W 3924 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 STE5YDR103W 2754 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 TAR1YLR154W-C 375 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 CYB5YNL111C 363 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 NUT2YPR168W 474 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 NUP170YBL079W 4509 nt1.87□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YFL063WYFL063W 456 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 RPL39YJL189W 156 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 MCM22YJR135C 720 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 PAU18YLL064C 363 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 PAU6YNR076W 363 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YDR341CYDR341C 1824 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 RPH1YER169W 2391 nt1.86□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 snR65snR65 100 nt1.85□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.85□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 UPS1YLR193C 528 nt1.85□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 FMP23YBR047W 528 nt1.85□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.85□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 SYH1YPL105C 2550 nt1.84□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.84□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 RPL37BYDR500C 267 nt1.84□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 CYC7YEL039C 342 nt1.84□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 YEL057CYEL057C 702 nt1.84□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 RPL38YLR325C 237 nt1.84□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 HTB2YBL002W 396 nt1.84□□□□□ -2.11
SSK1Q07084 KOG1YHR186C 4674 nt1.84□□□□□ -2.12
SSK1Q07084 EFR3YMR212C 2349 nt1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 127 ms