Protein–RNA interactions for Protein: P53758

YNR077C, UPF0320 protein YNR077C, yeastyeast

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR077CP53758 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.88□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 SVS1YPL163C 783 nt0.88□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YBR071WYBR071W 636 nt0.88□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YPR063CYPR063C 423 nt0.88□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 SEC3YER008C 4011 nt0.88□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 SLX4YLR135W 2247 nt0.88□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.87□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 IRC16YPR038W 360 nt0.87□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.87□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 SPR3YGR059W 1539 nt0.87□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 TOF2YKR010C 2316 nt0.87□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 VPS54YDR027C 2670 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 SHE9YDR393W 1371 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 BEM2YER155C 6504 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YGL217CYGL217C 342 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 RPL34BYIL052C 366 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YKL123WYKL123W 381 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 RPL9BYNL067W 576 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YBR032WYBR032W 303 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 KIP1YBL063W 3336 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 VAM6YDL077C 3150 nt0.86□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YDR250CYDR250C 276 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 MET32YDR253C 576 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YDR509WYDR509W 348 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 PAU2YEL049W 363 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 ILM1YJR118C 612 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YJR141WYJR141W 1044 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 GDS1YOR355W 1569 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YOP1YPR028W 543 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YPR039WYPR039W 336 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 SCC2YDR180W 4482 nt0.85□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.84□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.84□□□□□ -2.27
YNR077CP53758 YDL016CYDL016C 303 nt0.83□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 UBX4YMR067C 1251 nt0.83□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 MEI5YPL121C 669 nt0.83□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 CLU1YMR012W 3834 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 APL1YJR005W 2103 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 NUP188YML103C 4968 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 SRP14YDL092W 441 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YDR008CYDR008C 351 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YEL057CYEL057C 702 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YLL020CYLL020C 306 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 CDC31YOR257W 486 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YCL023CYCL023C 348 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 NOC3YLR002C 1992 nt0.82□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 SNU56YDR240C 1479 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 PEX8YGR077C 1770 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 snR84snR84 550 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YDR114CYDR114C 303 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 SWI6YLR182W 2412 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 SWI4YER111C 3282 nt0.81□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 MKT1YNL085W 2493 nt0.8□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 PIP2YOR363C 2991 nt0.8□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YDR029WYDR029W 315 nt0.8□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 TMA22YJR014W 597 nt0.8□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YLR255CYLR255C 354 nt0.8□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 SPT21YMR179W 2277 nt0.8□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YCS4YLR272C 3531 nt0.8□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 PIG1YLR273C 1947 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 SPO23YBR250W 1572 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 MXR1YER042W 555 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 RTR1YER139C 681 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 snR13snR13 124 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YPP1YGR198W 2454 nt0.79□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 AIM44YPL158C 2277 nt0.78□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 LYS14YDR034C 2373 nt0.78□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 NUP145YGL092W 3954 nt0.78□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 NUT1YGL151W 3399 nt0.78□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 YAP3YHL009C 993 nt0.78□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 APQ13YJL075C 417 nt0.78□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 TSC3YBR058C-A 243 nt0.78□□□□□ -2.28
YNR077CP53758 TRM732YMR259C 4263 nt0.77□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 MPT5YGL178W 2580 nt0.77□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 YGR025WYGR025W 303 nt0.77□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 snR14snR14 160 nt0.77□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 MDS3YGL197W 4464 nt0.77□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.76□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 RPL9AYGL147C 576 nt0.76□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 HUR1YGL168W 333 nt0.76□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 BIG1YHR101C 1008 nt0.76□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 HIT1YJR055W 495 nt0.76□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 SAS3YBL052C 2496 nt0.76□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 MSH3YCR092C 3057 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 GUP1YGL084C 1683 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 SPT7YBR081C 3999 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.75□□□□□ -2.29
YNR077CP53758 SDH2YLL041C 801 nt0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.6 ms