Protein–RNA interactions for Protein: P38729

YHL042W, Putative uncharacterized protein YHL042W, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL042WP38729 CDC24YAL041W 2565 nt0.77□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SWI5YDR146C 2130 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YIL029CYIL029C 429 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SPC1YJR010C-A 285 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 RPL40BYKR094C 387 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 PKR1YMR123W 369 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 TRM3YDL112W 4311 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SEC3YER008C 4011 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 MAK10YEL053C 2202 nt0.76□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 ZRG17YNR039C 1818 nt0.75□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 GDS1YOR355W 1569 nt0.75□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YGR265WYGR265W 411 nt0.75□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 EMC5YIL027C 426 nt0.75□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.75□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 HDA3YPR179C 1968 nt0.75□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SHE9YDR393W 1371 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YDL016CYDL016C 303 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 snR84snR84 550 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 UBX4YMR067C 1251 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YPR099CYPR099C 357 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 PAN3YKL025C 2040 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 DCP2YNL118C 2913 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 CDC39YCR093W 6327 nt0.74□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SNU56YDR240C 1479 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SCC2YDR180W 4482 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YDL152WYDL152W 366 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YDR029WYDR029W 315 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YDR509WYDR509W 348 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YJR141WYJR141W 1044 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YOP1YPR028W 543 nt0.73□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YLL054CYLL054C 2532 nt0.72□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.72□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YKL044WYKL044W 321 nt0.72□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 RPS18BYML026C 441 nt0.72□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 RPL9BYNL067W 576 nt0.72□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 YBR032WYBR032W 303 nt0.72□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 SLM6YBR266C 453 nt0.72□□□□□ -2.29
YHL042WP38729 ZIP1YDR285W 2628 nt0.71□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 SGO1YOR073W 1773 nt0.71□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YPP1YGR198W 2454 nt0.71□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.71□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YBL073WYBL073W 312 nt0.71□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YPR039WYPR039W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 IFH1YLR223C 3258 nt0.71□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 SPR3YGR059W 1539 nt0.7□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 LAA1YJL207C 6045 nt0.7□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YDR250CYDR250C 276 nt0.7□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 RTR1YER139C 681 nt0.7□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.7□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 SDH2YLL041C 801 nt0.7□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 BER1YLR412W 825 nt0.7□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 VPS54YDR027C 2670 nt0.69□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YKL123WYKL123W 381 nt0.69□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 NUT2YPR168W 474 nt0.69□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 DOP1YDR141C 5097 nt0.69□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 NUP192YJL039C 5052 nt0.69□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 MKT1YNL085W 2493 nt0.69□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YER135CYER135C 393 nt0.68□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 SPO75YLL005C 2607 nt0.68□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 MEI5YPL121C 669 nt0.68□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 SVS1YPL163C 783 nt0.68□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YBR071WYBR071W 636 nt0.68□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 SPT21YMR179W 2277 nt0.68□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 EAF1YDR359C 2949 nt0.67□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 HUR1YGL168W 333 nt0.67□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 STB6YKL072W 2301 nt0.67□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 SAS3YBL052C 2496 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 KIP1YBL063W 3336 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YDR008CYDR008C 351 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YHL037CYHL037C 402 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 ILM1YJR118C 612 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 RPL32YBL092W 393 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 IRC23YOR044W 474 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 PIP2YOR363C 2991 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 TOF2YKR010C 2316 nt0.66□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 LYS14YDR034C 2373 nt0.65□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YGR130CYGR130C 2451 nt0.65□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 YPR117WYPR117W 7470 nt0.65□□□□□ -2.3
YHL042WP38729 KAP120YPL125W 3099 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 ROM2YLR371W 4071 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 OCA6YDR067C 675 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 YGR025WYGR025W 303 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 APQ13YJL075C 417 nt0.65□□□□□ -2.31
YHL042WP38729 PHS1YJL097W 654 nt0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.5 ms