Protein–RNA interactions for Protein: P0CX85

RPL35B, 60S ribosomal protein L35-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35BP0CX85 HDA3YPR179C 1968 nt0.67□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.67□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 NUP120YKL057C 3114 nt0.67□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 SEC1YDR164C 2175 nt0.66□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 OST1YJL002C 1431 nt0.66□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 GPM2YDL021W 936 nt0.66□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.66□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.66□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.66□□□□□ -2.3
RPL35BP0CX85 TDA2YER071C 381 nt0.65□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt0.65□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YOR364WYOR364W 369 nt0.65□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 ATP20YPR020W 348 nt0.65□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 NUT2YPR168W 474 nt0.65□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 SAG1YJR004C 1953 nt0.65□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YDL206WYDL206W 2289 nt0.64□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 BUD26YDR241W 288 nt0.64□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YGL109WYGL109W 324 nt0.64□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YGR045CYGR045C 363 nt0.64□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 NUT1YGL151W 3399 nt0.64□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YAR009CYAR009C 3591 nt0.63□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 SWI5YDR146C 2130 nt0.63□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 SMB1YER029C 591 nt0.63□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.63□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.63□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YJR003CYJR003C 1560 nt0.62□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 MXR1YER042W 555 nt0.62□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 CMC4YMR194C-B 222 nt0.62□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.62□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YOL106WYOL106W 354 nt0.62□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 NUP157YER105C 4176 nt0.6□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 RRI2YOL117W 1938 nt0.6□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 SRP14YDL092W 441 nt0.6□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.6□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YMR160WYMR160W 2451 nt0.6□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YDL073WYDL073W 2955 nt0.59□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 NHP2YDL208W 471 nt0.59□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 ACF4YJR083C 930 nt0.59□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.59□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 TFB6YOR352W 1032 nt0.59□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 YOP1YPR028W 543 nt0.59□□□□□ -2.31
RPL35BP0CX85 SET3YKR029C 2256 nt0.59□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YLL007CYLL007C 1998 nt0.59□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 VPS52YDR484W 1926 nt0.58□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 PIG1YLR273C 1947 nt0.58□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 FIG4YNL325C 2640 nt0.58□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 snR79snR79 84 nt0.58□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.58□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YDR521WYDR521W 336 nt0.58□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 CUP1-1YHR053C 186 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 CUP1-2YHR055C 186 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YOR199WYOR199W 330 nt0.57□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 STO1YMR125W 2586 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YML002WYML002W 2214 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 URM1YIL008W 300 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 BMT5YIL096C 1011 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YNL150WYNL150W 408 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 IES4YOR189W 351 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 SCW11YGL028C 1629 nt0.56□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 PDE2YOR360C 1581 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YDL196WYDL196W 330 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YDR509WYDR509W 348 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 ALG13YGL047W 609 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 LIN1YHR156C 1023 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 HIT1YJR055W 495 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 RPL38YLR325C 237 nt0.55□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YDL152WYDL152W 366 nt0.54□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.54□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.54□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 SLM6YBR266C 453 nt0.54□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.53□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 HNT1YDL125C 477 nt0.53□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.53□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 RUF22RUF22 515 nt0.53□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 UTP20YBL004W 7482 nt0.53□□□□□ -2.32
RPL35BP0CX85 PRP16YKR086W 3216 nt0.53□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 SWF1YDR126W 1011 nt0.52□□□□□ -2.33
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