Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VPREB3Q9UKI3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms