Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4BQ9NT99 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms