Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1CQ15572 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1CQ15572 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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