Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
EEA1Q15075 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EEA1Q15075 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EEA1Q15075 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
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