Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.12□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 SET2YJL168C 2202 nt5.11□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 EXO84YBR102C 2262 nt5.11□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt5.11□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 SNF3YDL194W 2655 nt5.11□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 GIP4YAL031C 2283 nt5.1□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 RPG1YBR079C 2895 nt5.1□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 SMT3YDR510W 306 nt5.09□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 YLL020CYLL020C 306 nt5.09□□□□□ -1.59
TSR3Q12094 NAT1YDL040C 2565 nt5.09□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 CIN1YOR349W 3045 nt5.08□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 YGR125WYGR125W 3111 nt5.08□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 RAD53YPL153C 2466 nt5.08□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 YKL050CYKL050C 2769 nt5.08□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 KAP120YPL125W 3099 nt5.08□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 CCM1YGR150C 2595 nt5.07□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 TTI1YKL033W 3117 nt5.07□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 SEF1YBL066C 3447 nt5.07□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 TCO89YPL180W 2400 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 ASK10YGR097W 3441 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 SNT1YCR033W 3681 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 UBP11YKR098C 2154 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 RPH1YER169W 2391 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 PUT3YKL015W 2940 nt5.06□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 CDC15YAR019C 2925 nt5.05□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt5.05□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 YKL225WYKL225W 348 nt5.05□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 YJR085CYJR085C 318 nt5.04□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 PWP2YCR057C 2772 nt5.04□□□□□ -1.6
TSR3Q12094 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt5.02□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 YLR041WYLR041W 321 nt5.02□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 SAK1YER129W 3429 nt5.02□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 HFM1YGL251C 3564 nt5.01□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 snR7-SsnR7-S 179 nt5.01□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 RPL23BYER117W 414 nt5.01□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt5□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt5□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 EGT2YNL327W 3126 nt5□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 YPL150WYPL150W 2706 nt5□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 MDR1YGR100W 2853 nt4.99□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 SKP2YNL311C 2292 nt4.99□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 YIL080WYIL080W 4722 nt4.98□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 RPL14AYKL006W 417 nt4.98□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 RGM1YMR182C 636 nt4.98□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 RSM19YNR037C 276 nt4.98□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 ADP1YCR011C 3150 nt4.98□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 YDR089WYDR089W 2610 nt4.98□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 SWI5YDR146C 2130 nt4.97□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 LHS1YKL073W 2646 nt4.97□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 APL2YKL135C 2181 nt4.97□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 VPS35YJL154C 2835 nt4.97□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 MPH1YIR002C 2982 nt4.96□□□□□ -1.61
TSR3Q12094 YMR31YFR049W 372 nt4.96□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt4.96□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YLR352WYLR352W 2424 nt4.96□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YPP1YGR198W 2454 nt4.96□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YKU80YMR106C 1890 nt4.95□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt4.95□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 RPS12YOR369C 432 nt4.95□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 IFH1YLR223C 3258 nt4.95□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 BBC1YJL020C 3474 nt4.95□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 VHC1YBR235W 3363 nt4.94□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 RPS23BYPR132W 438 nt4.94□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 INP53YOR109W 3324 nt4.94□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 RRP6YOR001W 2202 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 RTC1YOL138C 4026 nt4.93□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 SPT16YGL207W 3108 nt4.92□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt4.92□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 RIA1YNL163C 3333 nt4.92□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 PMC1YGL006W 3522 nt4.92□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 ATG11YPR049C 3537 nt4.92□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 RAD54YGL163C 2697 nt4.91□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 CRM1YGR218W 3255 nt4.91□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 PTP3YER075C 2787 nt4.91□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.91□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt4.91□□□□□ -1.62
TSR3Q12094 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.91□□□□□ -1.62
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