Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.86□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 HHT1YBR010W 411 nt0.86□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 ATP20YPR020W 348 nt0.86□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 NST1YNL091W 3723 nt0.86□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 snR5snR5 204 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 FSH1YHR049W 732 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YPR063CYPR063C 423 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YBR287WYBR287W 1284 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 SNF5YBR289W 2718 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 SMY1YKL079W 1971 nt0.85□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 SIP4YJL089W 2490 nt0.84□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 IRR1YIL026C 3453 nt0.84□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 UFD2YDL190C 2886 nt0.84□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 SDS22YKL193C 1017 nt0.84□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 CTK3YML112W 891 nt0.84□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 YPL039WYPL039W 951 nt0.84□□□□□ -2.27
UPS3Q04006 REF2YDR195W 1602 nt0.84□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 DOP1YDR141C 5097 nt0.84□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 IML1YJR138W 4755 nt0.84□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 VPS52YDR484W 1926 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 RPL40BYKR094C 387 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 RPL37AYLR185W 267 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YOR376WYOR376W 369 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YBR063CYBR063C 1215 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YCL002CYCL002C 792 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 DCP2YNL118C 2913 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 NUP188YML103C 4968 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 OSH6YKR003W 1347 nt0.83□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YDL211CYDL211C 1119 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 MND1YGL183C 660 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 LRP1YHR081W 555 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YLR198CYLR198C 360 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 RPS18BYML026C 441 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YCL046WYCL046W 324 nt0.82□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 IES5YER092W 378 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YGR228WYGR228W 345 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 CRG1YHR209W 876 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 COX7YMR256C 183 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YPR146CYPR146C 330 nt0.81□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 MUK1YPL070W 1839 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 SMC1YFL008W 3678 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 TIM10YHR005C-A 282 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 RCN1YKL159C 636 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 PAU18YLL064C 363 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 PKR1YMR123W 369 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 PAU6YNR076W 363 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YPR096CYPR096C 303 nt0.8□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 BI4Q0120 1917 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YDR220CYDR220C 294 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 SPC1YJR010C-A 285 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YMR254CYMR254C 309 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YPL197CYPL197C 414 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YPR147CYPR147C 915 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YGR130CYGR130C 2451 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 SPR3YGR059W 1539 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YBR184WYBR184W 1572 nt0.79□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 snR79snR79 84 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YGR265WYGR265W 411 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 RPL42BYHR141C 321 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 BMT5YIL096C 1011 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YLL020CYLL020C 306 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YLR271WYLR271W 825 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YML003WYML003W 873 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 DDR48YMR173W 1293 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 RPL42AYNL162W 321 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 DCP1YOL149W 696 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 IPP1YBR011C 864 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 TIM18YOR297C 579 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 snR14snR14 160 nt0.78□□□□□ -2.28
UPS3Q04006 SEF1YBL066C 3447 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 CDC39YCR093W 6327 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 snR9snR9 187 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 CHZ1YER030W 462 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YER121WYER121W 345 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 RTR1YER139C 681 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YGL217CYGL217C 342 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YIR020CYIR020C 303 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 FMP23YBR047W 528 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 CSM4YPL200W 471 nt0.77□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 BUD3YCL014W 4911 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YCS4YLR272C 3531 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 IFH1YLR223C 3258 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 CDC24YAL041W 2565 nt0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.5 ms