Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 TFC8YPL007C 1767 nt1.79□□□□□ -2.12
CIK1Q01649 MDM20YOL076W 2391 nt1.79□□□□□ -2.12
CIK1Q01649 IRR1YIL026C 3453 nt1.78□□□□□ -2.12
CIK1Q01649 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.78□□□□□ -2.12
CIK1Q01649 LHS1YKL073W 2646 nt1.78□□□□□ -2.12
CIK1Q01649 SAR1YPL218W 573 nt1.78□□□□□ -2.12
CIK1Q01649 SNF5YBR289W 2718 nt1.78□□□□□ -2.12
CIK1Q01649 MON2YNL297C 4911 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 COX1Q0045 1605 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 ASM4YDL088C 1587 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 QCR7YDR529C 384 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 CRG1YHR209W 876 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 TRX1YLR043C 312 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 SEF1YBL066C 3447 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 MSH6YDR097C 3729 nt1.77□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 NOP53YPL146C 1368 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 MXR1YER042W 555 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 RPL16AYIL133C 600 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 snR13snR13 124 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.76□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 CTR9YOL145C 3234 nt1.75□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YDL152WYDL152W 366 nt1.75□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 ATP17YDR377W 306 nt1.75□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 HUR1YGL168W 333 nt1.75□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YGR025WYGR025W 303 nt1.75□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 KCS1YDR017C 3153 nt1.75□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YLR419WYLR419W 4308 nt1.75□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 ADR1YDR216W 3972 nt1.74□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 IRE1YHR079C 3348 nt1.74□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 ABM1YJR108W 372 nt1.74□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.74□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 EGD1YPL037C 474 nt1.74□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.74□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 GYP5YPL249C 2685 nt1.74□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YSW1YBR148W 1830 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 RLM1YPL089C 2031 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 DAD4YDR320C-A 219 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YGR045CYGR045C 363 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YGR290WYGR290W 444 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 TMA22YJR014W 597 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YNL122CYNL122C 348 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 TSC3YBR058C-A 243 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YPR099CYPR099C 357 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 LOA1YPR139C 903 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 DOT6YER088C 2013 nt1.73□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 SKI3YPR189W 4299 nt1.72□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YHR130CYHR130C 336 nt1.72□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 RPL42BYHR141C 321 nt1.72□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YLR255CYLR255C 354 nt1.72□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.72□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 RPL42AYNL162W 321 nt1.72□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YJR098CYJR098C 1971 nt1.72□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 VPS34YLR240W 2628 nt1.71□□□□□ -2.13
CIK1Q01649 YCR001WYCR001W 315 nt1.71□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 MTC7YEL033W 420 nt1.71□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 FMP23YBR047W 528 nt1.71□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.71□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 FAB1YFR019W 6837 nt1.71□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 HMI1YOL095C 2121 nt1.7□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 GNT1YOR320C 1476 nt1.7□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 RPF1YHR088W 888 nt1.7□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YBL073WYBL073W 312 nt1.7□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 SPO24YPR036W-A 204 nt1.7□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YER135CYER135C 393 nt1.69□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 MCM22YJR135C 720 nt1.69□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YML108WYML108W 318 nt1.69□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YNL114CYNL114C 372 nt1.69□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YOR019WYOR019W 2193 nt1.69□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 SBE22YHR103W 2559 nt1.68□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 PAN3YKL025C 2040 nt1.68□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YGR265WYGR265W 411 nt1.68□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YLR269CYLR269C 351 nt1.68□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.68□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 MSH5YDL154W 2706 nt1.68□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 ATG11YPR049C 3537 nt1.67□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 RKM1YPL208W 1752 nt1.67□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.67□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.67□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 FYV7YLR068W 456 nt1.67□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YBR032WYBR032W 303 nt1.67□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 OSH6YKR003W 1347 nt1.66□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.66□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 PAU18YLL064C 363 nt1.66□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 PAU6YNR076W 363 nt1.66□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 YCL046WYCL046W 324 nt1.66□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 FRK1YPL141C 2598 nt1.66□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 CTF4YPR135W 2784 nt1.66□□□□□ -2.14
CIK1Q01649 BI2Q0110 1272 nt1.65□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 AIM29YKR074W 468 nt1.65□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 SYM1YLR251W 594 nt1.65□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YDR509WYDR509W 348 nt1.64□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YHR125WYHR125W 306 nt1.64□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.64□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 YBR174CYBR174C 315 nt1.64□□□□□ -2.15
CIK1Q01649 HDA3YPR179C 1968 nt1.64□□□□□ -2.15
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