Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 NET1YJL076W 3570 nt2.41□□□□□ -2.02
XBP1P40489 VIK1YPL253C 1944 nt2.4□□□□□ -2.02
XBP1P40489 PDR3YBL005W 2931 nt2.4□□□□□ -2.02
XBP1P40489 snR60snR60 104 nt2.4□□□□□ -2.03
XBP1P40489 LSO2YGR169C-A 279 nt2.4□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RAM2YKL019W 951 nt2.4□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.4□□□□□ -2.03
XBP1P40489 ASG1YIL130W 2895 nt2.4□□□□□ -2.03
XBP1P40489 DSE4YNR067C 3354 nt2.4□□□□□ -2.03
XBP1P40489 PSO2YMR137C 1986 nt2.4□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 FLO11YIR019C 4104 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 BCK1YJL095W 4437 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 NPC2YDL046W 522 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YJL135WYJL135W 318 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RLF2YPR018W 1821 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 PSY2YNL201C 2577 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 CYR1YJL005W 6081 nt2.39□□□□□ -2.03
XBP1P40489 NCL1YBL024W 2055 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 NPR3YHL023C 3441 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 TOR1YJR066W 7413 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RBK1YCR036W 1002 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 TIM11YDR322C-A 291 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YLR140WYLR140W 327 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RPL38YLR325C 237 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 GIN4YDR507C 3429 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YJL070CYJL070C 2667 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 AI2Q0055 2565 nt2.38□□□□□ -2.03
XBP1P40489 KAR3YPR141C 2190 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 ECM29YHL030W 5607 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 BOI1YBL085W 2943 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 snR85snR85 171 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YGL024WYGL024W 336 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YIL059CYIL059C 366 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 VPS55YJR044C 423 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RPS27AYKL156W 249 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RPL25YOL127W 429 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YOR015WYOR015W 360 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YPR203WYPR203W 309 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 TOM1YDR457W 9807 nt2.37□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YGR250CYGR250C 2346 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YPL150WYPL150W 2706 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RAX2YLR084C 3663 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 MOT1YPL082C 5604 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YGL069CYGL069C 465 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 UPS1YLR193C 528 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YMR321CYMR321C 318 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 snR43snR43 209 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 SRO77YBL106C 3033 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 IPT1YDR072C 1584 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 JSN1YJR091C 3276 nt2.36□□□□□ -2.03
XBP1P40489 SAK1YER129W 3429 nt2.35□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YEL014CYEL014C 306 nt2.35□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RPL20AYMR242C 519 nt2.35□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YNL028WYNL028W 318 nt2.35□□□□□ -2.03
XBP1P40489 AXL1YPR122W 3627 nt2.35□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 YCL019WYCL019W 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 SPB1YCL054W 2526 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 POM152YMR129W 4014 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 CSE2YNR010W 450 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 RTC6YPL183W-A 282 nt2.34□□□□□ -2.03
XBP1P40489 HDA3YPR179C 1968 nt2.34□□□□□ -2.04
XBP1P40489 RLI1YDR091C 1827 nt2.33□□□□□ -2.04
XBP1P40489 NEW1YPL226W 3591 nt2.33□□□□□ -2.04
XBP1P40489 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.33□□□□□ -2.04
XBP1P40489 OLI1Q0130 231 nt2.33□□□□□ -2.04
XBP1P40489 RPO41YFL036W 4056 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 RGR1YLR071C 3249 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 SEC26YDR238C 2922 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 YDR209CYDR209C 414 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 PCC1YKR095W-A 267 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 YLR255CYLR255C 354 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 ESC1YMR219W 4977 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 SAP1YER047C 2694 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 YOL057WYOL057W 2136 nt2.32□□□□□ -2.04
XBP1P40489 PUF4YGL014W 2667 nt2.31□□□□□ -2.04
XBP1P40489 PRE4YFR050C 801 nt2.31□□□□□ -2.04
XBP1P40489 LSM7YNL147W 348 nt2.31□□□□□ -2.04
XBP1P40489 LCD1YDR499W 2244 nt2.31□□□□□ -2.04
XBP1P40489 MPH1YIR002C 2982 nt2.31□□□□□ -2.04
XBP1P40489 DFG16YOR030W 1860 nt2.31□□□□□ -2.04
XBP1P40489 DOT6YER088C 2013 nt2.3□□□□□ -2.04
XBP1P40489 YER189WYER189W 369 nt2.3□□□□□ -2.04
XBP1P40489 RRT15YLR162W-A 189 nt2.3□□□□□ -2.04
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