Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms