Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC82Q8N4S0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms