Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC62Q6P9F0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms