Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3C1V9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3C1V9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3C1V9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3C1V9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3C1V9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3C1V9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms