Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1CQ15572 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1CQ15572 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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