Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YMR324CYMR324C 243 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YPL039WYPL039W 951 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 MEI5YPL121C 669 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 RTC6YPL183W-A 282 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YPR172WYPR172W 603 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 SEC21YNL287W 2808 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 ZRG8YER033C 3231 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 FYV8YGR196C 2454 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 SPC110YDR356W 2835 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 BST1YFL025C 3090 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 SCEIQ0160 708 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 GIC1YHR061C 945 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 MCM22YJR135C 720 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 CMC2YBL059C-A 330 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YNL010WYNL010W 726 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YPL080CYPL080C 327 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 ASM4YDL088C 1587 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 NUP82YJL061W 2142 nt1.28□□□□□ -2.2
USB1Q12208 PET127YOR017W 2403 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 GNT1YOR320C 1476 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YCL020WYCL020W 1317 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 MZM1YDR493W 372 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 SLX9YGR081C 633 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YIR020CYIR020C 303 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 PFD1YJL179W 330 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 PRP21YJL203W 843 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 PHO80YOL001W 882 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 CDC31YOR257W 486 nt1.27□□□□□ -2.21
USB1Q12208 MDM20YOL076W 2391 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 CTR9YOL145C 3234 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YDL187CYDL187C 330 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 LAG1YHL003C 1236 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 BUD19YJL188C 309 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YAR068WYAR068W 486 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 NBP1YLR457C 960 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YOL029CYOL029C 606 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YPR147CYPR147C 915 nt1.26□□□□□ -2.21
USB1Q12208 MUD2YKL074C 1584 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 HMI1YOL095C 2121 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 TBS1YBR150C 3285 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 KCS1YDR017C 3153 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 SPE1YKL184W 1401 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 SPC98YNL126W 2541 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 AFR1YDR085C 1863 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YDR220CYDR220C 294 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 LSO2YGR169C-A 279 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YLR271WYLR271W 825 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 SEN15YMR059W 387 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 ROX1YPR065W 1107 nt1.25□□□□□ -2.21
USB1Q12208 RTR2YDR066C 591 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 VOA1YGR106C 798 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 LRP1YHR081W 555 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 SWS2YNL081C 432 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 MSH3YCR092C 3057 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 BI4Q0120 1917 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 CDC27YBL084C 2277 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 POL5YEL055C 3069 nt1.24□□□□□ -2.21
USB1Q12208 CMS1YLR003C 876 nt1.23□□□□□ -2.21
USB1Q12208 MAD1YGL086W 2250 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YDL041WYDL041W 354 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YGL015CYGL015C 393 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 YJL015CYJL015C 285 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 RPL37AYLR185W 267 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 SNC2YOR327C 348 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 MNL2YLR057W 2550 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 NOT5YPR072W 1683 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 MDM32YOR147W 1869 nt1.22□□□□□ -2.21
USB1Q12208 SWT1YOR166C 1377 nt1.21□□□□□ -2.21
USB1Q12208 DAS1YJL149W 1992 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YGR250CYGR250C 2346 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 PHR1YOR386W 1698 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YDL068WYDL068W 330 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 IRC19YLL033W 693 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YLR140WYLR140W 327 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 SEC22YLR268W 645 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 COX7YMR256C 183 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YBL083CYBL083C 426 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YOR152CYOR152C 771 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 HKR1YDR420W 5409 nt1.21□□□□□ -2.22
USB1Q12208 RVS161YCR009C 798 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 PRM8YGL053W 714 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YKL123WYKL123W 381 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 RPB11YOL005C 363 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 EGD1YPL037C 474 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YPL197CYPL197C 414 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YBR224WYBR224W 516 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 RSM22YKL155C 1887 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 NCA2YPR155C 1851 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 DOT6YER088C 2013 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 KAR3YPR141C 2190 nt1.2□□□□□ -2.22
USB1Q12208 VMA21YGR105W 234 nt1.19□□□□□ -2.22
USB1Q12208 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.19□□□□□ -2.22
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