Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.9□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.9□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YAR068WYAR068W 486 nt1.9□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 GAL7YBR018C 1101 nt1.9□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 NAM7YMR080C 2916 nt1.9□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 BRE1YDL074C 2103 nt1.9□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 CFT2YLR115W 2580 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 RPS22BYLR367W 393 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 RPS18BYML026C 441 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 CYB5YNL111C 363 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 PGA1YNL158W 597 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 PET123YOR158W 957 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 PLC1YPL268W 2610 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 ASM4YDL088C 1587 nt1.89□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YCR001WYCR001W 315 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 SEC31YDL195W 3822 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 BI2Q0110 1272 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YLR171WYLR171W 390 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YLR202CYLR202C 327 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YML108WYML108W 318 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 RPH1YER169W 2391 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 PUT3YKL015W 2940 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 LYS9YNR050C 1341 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 HER1YOR227W 3741 nt1.88□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 INO80YGL150C 4470 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 MGA2YIR033W 3342 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 ATP17YDR377W 306 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 BRP1YGL007W 378 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YGL024WYGL024W 336 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 HUR1YGL168W 333 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YGR025WYGR025W 303 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 AIM29YKR074W 468 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 TMA7YLR262C-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YLR269CYLR269C 351 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YLR456WYLR456W 615 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 snR13snR13 124 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YBR224WYBR224W 516 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 GCN2YDR283C 4980 nt1.87□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 ARP7YPR034W 1434 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 LRE1YCL051W 1752 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 RPF1YHR088W 888 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YHR125WYHR125W 306 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YPL068CYPL068C 882 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 COX1Q0045 1605 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 FKS1YLR342W 5631 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 MSS11YMR164C 2277 nt1.86□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 DIS3YOL021C 3006 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 PET309YLR067C 2898 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 MNL2YLR057W 2550 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 RBK1YCR036W 1002 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 FCF2YLR051C 654 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YBL083CYBL083C 426 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 TSC3YBR058C-A 243 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 DFG16YOR030W 1860 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 HCS1YKL017C 2052 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 TOR2YKL203C 7425 nt1.85□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 KOG1YHR186C 4674 nt1.84□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 VTC3YPL019C 2508 nt1.84□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YCR043CYCR043C 384 nt1.84□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 RPS24AYER074W 408 nt1.84□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 YPL238CYPL238C 390 nt1.84□□□□□ -2.11
AEP3Q12089 PEP3YLR148W 2757 nt1.84□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 SLM1YIL105C 2061 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 BTT1YDR252W 450 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 TMA22YJR014W 597 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 SYM1YLR251W 594 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 EGD1YPL037C 474 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YPR146CYPR146C 330 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 NAB6YML117W 3405 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 DAS1YJL149W 1992 nt1.83□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 NUP170YBL079W 4509 nt1.82□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 QCR7YDR529C 384 nt1.82□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 NBL1YHR199C-A 222 nt1.82□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.82□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 SAP190YKR028W 3102 nt1.82□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 SMY1YKL079W 1971 nt1.81□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YER135CYER135C 393 nt1.81□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 ECL1YGR146C 636 nt1.81□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 RPA34YJL148W 702 nt1.81□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 TIF11YMR260C 462 nt1.81□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 snR54snR54 86 nt1.81□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 LHS1YKL073W 2646 nt1.81□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YSW1YBR148W 1830 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 APL5YPL195W 2799 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 PAU14YIL176C 363 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 PAU1YJL223C 363 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 TOM22YNL131W 459 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YNL144CYNL144C 2223 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 SLN1YIL147C 3663 nt1.8□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 ZRG8YER033C 3231 nt1.79□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YDL152WYDL152W 366 nt1.79□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.79□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YHR210CYHR210C 1026 nt1.79□□□□□ -2.12
AEP3Q12089 YBL012CYBL012C 402 nt1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms